Improve data generation - Githubissues

Oncostat / grstat

Statistical package for clinical research in GR

https://oncostat.github.io/grstat/

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Improve data generation #4

Open DanChaltiel opened 2 months ago

DanChaltiel commented 2 months ago

On a besoin de données plus robustes et diversifiées pour les exemples et les tests.

En l'état, le package utilise grstat_example() :

https://github.com/Oncostat/grstat/blob/d5ec96670ffa0477b08525644249d1b649d75080/R/data.R#L42

Nous avons besoin de plusieurs autres fonctionnalités :

Priorité 1: les AE

[ ] Ajouter le TERM en plus du SOC
[ ] Ajouter des données manquantes dans toutes les colonnes, peut-être avec une proportion variable, par exemple p_na=0.1.
[ ] Passer n_ae_max en tant qu'argument, possiblement lié au traitement
[ ] Gérer certains cas particuliers, cf. https://github.com/Oncostat/grstat/issues/8.

Priorité 2: le RECIST

[ ] Ajouter des données RECIST simulées pour les fonctions futures (waterfall plots et swimmer plots).

Utils

Package pour rendre des data plus bordéliques : https://github.com/nrennie/messy

charlottebargain commented 1 month ago

[ ] randomization different than 1:1
[ ] several (>2) arms
[ ] missing data for an entire arm
[ ] create functions get_soc(), get_terms()
[ ] duplicates SOC with different grades for one patient
[ ] SOC and grade depending on treatment arm