REMARK DSDP RESULT: 0.000000

[zfzzfzzfz]

我出现问题：Blind docking和Redocking均可以运行，之前可以输出对接得分，但是后来REMARK DSDP RESULT: 0.000000，无法有效的进行对接。

[PKUGaoGroup]

感谢您的反馈，这可能是cuda没有被成功编译。您可以尝试把DSDP_redocking和DSDP_blind_docking里面的Makefile文件修改一下。 修改方式为：1.将arch=sm_70 改为arch=sm_60；2. make clean；3. make

我出现问题：Blind docking和Redocking均可以运行，之前可以输出对接得分，但是后来REMARK DSDP RESULT: 0.000000，无法有效的进行对接。

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感谢您的反馈，这可能是cuda没有被成功编译。您可以尝试把DSDP_redocking和DSDP_blind_docking里面的Makefile文件修改一下。 修改方式为：1.将arch=sm_70 改为arch=sm_60；2. make clean；3. make

我出现问题：Blind docking和Redocking均可以运行，之前可以输出对接得分，但是后来REMARK DSDP RESULT: 0.000000，无法有效的进行对接。

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作者您好，非常感谢您的反馈，我将arch=sm_60再重新make clean和make：nvcc -o DSDP main_SingleRun.o common.o CLUSTER.o Copy_pdbqt_Format.o DSDP_Sort.o DSDP_Task.o Kernel.o Neighbor_Grid.o Partial_Rigid_Small_Molecule.o Rigid_Protein.o Vina_Grid_Force_Field.o Site_Information.o -Xcompiler -fopenmp -arch=sm_60 -rdc=true -lcudadevrt -lcufft --use_fast_math -O4 -std=c++11 但是运行仍然结果仍然是： ./test_dataset/DSDP_dataset/1a2b/1a2b_ligand.pdbqt 0.000000 和 REMARK DSDP RESULT: 0.000000 环境是云端的（备份过），之前成功运行后根本没有变动过，就是突然就不行了！ 这是之前运行成功的版本： REMARK DSDP RESULT: -9.936342

[PKUGaoGroup]

那是不是云的cuda有变化，可以尝试重新从头编译一下试试看，现在DSDP有更新，可以下载这个新版本从头配置试一下。推测是cuda没有编译成功（虽然没有报错），使得程序内部cuda的部分没有运行，造成对接失败，arch=sm_60这个参数的配置，可以根据您云的硬件进行适配。