STAR 多サンプルのマッピングのエラー

[MasaNak1980]

STAR　多サンプルのマッピングを試みましたが、 こんなエラーが出て、進みませんでした。 basename: extra operand ‘../seq/SRR1551050_2.fastq.gz’ Try 'basename --help' for more information.

そこで、basename のコマンドをいじったら、うまくいきました。 for sample in ls ../seq/*fastq.gz | xargs basename | cut -f1 -d"_" | uniq; の　xargs basename　の部分を

xargs basename -s .fastq.gz

と変更したら、動き出しました。

参考にしていただければ幸いです。　

[RolyPolyCoily]

@MasaNak1980 お返事が大変遅くなってしまいました。エラーでお手数おかけし申し訳ございません。また解決策についてもご指摘くださりありがとうございます。反映させていただきました。