Open Ayum-dev opened 3 years ago
@Ayum-dev ご連絡ありがとうございます。似たエラーが出ている人がいますが、解決策は現時点では提示されていないようです。
期待はできませんが、公式ページにある、BiocManager::install("pachterlab/sleuth")
を実行してみていただけますでしょうか。
解決が難しい場合は、condaの仮想環境を準備して、そこにRやsleuthをインストールするのが手っ取り早いかもしれません。
たとえば:
conda create -n test
conda activate test
conda install --channel bioconda r-sleuth
which R
R
library(sleuth)
...
q()
conda deactivate
のようなコマンドでsleuthを使えるのではないかと思います。
こんにちは。 お世話になっております。 初心者です。
p103のところで
library("sleuth")
と入力するととなってしまい、その先に進めていない状況です。
R3.5以上のR4.1.2なので、
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("rhdf5")
としましたが
のような警告メッセージがでます。
install.packages("devtools")
を入力すると、上のようなメッセージがでて、 その後
devtools::install_github("pachterlab/sleuth")
を入力すると下のようなメッセージがでます。どうもrhdf5のインストールがうまくいっていないのだと思いますが、何が悪いのかわかりません。 お知恵をお貸しください。 よろしくお願いいたします。