SLKaMiHi / TD-Net-unsupervised-medical-image-registration-network-based-on-Transformer-and-CNN

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Some questions about data resize #1

Closed ypbhc1998 closed 2 years ago

ypbhc1998 commented 2 years ago

您好,我通过阅读文章发现在文章中您将Oasis数据集resize到[96×112×96]但是初始dice为0.5651,我使用的Oasis数据集大小为[140,166,140]初始dice在0.56附近,但是当我将它resize到96×112×96时,它的初始DICE只有0.3371。在我实验的过程中,我发现只要resize图片缩小尺寸,初始DICE就会降低,我不知道这是不是一个正常现象?还是我数据处理resize的时候出现了问题?如果可以的话,您可以将数据resize的代码公开一下吗?非常感谢。

SLKaMiHi commented 2 years ago

我是使用了scipy.ndimage.zoom() 函数进行的缩放操作。并且对于图像使用了双线性插值,对于label使用了最邻近插值。我的图像是从(160,192,224)的尺寸缩放到(96,112,96),我觉得可能是这个的影响。另外我不知道我们缩放的维度是否对应。希望能对你有所帮助。

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "SLKaMiHi/TD-Net-unsupervised-medical-image-registration-network-based-on-Transformer-and-CNN" @.>; 发送时间: 2022年4月19日(星期二) 中午11:12 @.>; @.***>; 主题: [SLKaMiHi/TD-Net-unsupervised-medical-image-registration-network-based-on-Transformer-and-CNN] Some questions about data resize (Issue #1)

您好,我通过阅读文章发现在文章中您将Oasis数据集resize到[96×112×96]但是初始dice为0.5651,我使用的Oasis数据集大小为[140,166,140]初始dice在0.56附近,但是当我将它resize到96×112×96时,它的初始DICE只有0.3371。在我实验的过程中,我发现只要resize图片缩小尺寸,初始DICE就会降低,我不知道这是不是一个正常现象?还是我数据处理resize的时候出现了问题?如果可以的话,您可以将数据resize的代码公开一下吗?非常感谢。

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ypbhc1998 commented 2 years ago

非常感谢你!我换了这个函数之后测试了一下发现我缩放后的图像dice没有降低了,这真的对我帮助很大~再次感谢!!