Saoge123 / ccgnet

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The problem of understanding Method part of Paper #3

Closed yuyouyu32 closed 2 years ago

yuyouyu32 commented 3 years ago

因为看您的论文是在四川大学发表的,所以请原谅我直接使用中文向您提问。

我是来自上海大学的计算机研究生新生,我对您的论文计算机实现方法非常感兴趣。在读您的论文时,是我第一次感受到论文可以这么清晰和高效的表达,您的论文每一个细节都非常详尽,我在此想先向您表达我深深的敬佩之意!!!

在读到您的Method部分,因为我英语水平不高,在借助翻译软件之后也没办法理解Node update function Φv中的h(c)的定义,h(c) is a scalar corresponding to a given input feature and a given slice of Al. 我理解是h也是训练的参数,类似W,所以特此向您求证。

我刚阅读完您的论文,马上会尽力理解您的代码,我看您在另一个问题回答了您的邮箱,如果您允许的话,我也想和您交流一些关于这篇论文的问题。

Saoge123 commented 3 years ago

抱歉Φv的定义在方法部分写的有点简略,其实可以参考原文献,里面说的很详细:https://doi.org/10.1109/JSTSP.2017.2726981

yuyouyu32 commented 3 years ago

非常感谢您的回答,我今天上课还没看您的代码和数据部分,非常抱歉,之后可能还需要向您请教,这个Issue就先不关闭了,再次感谢您的详细回答~!

yuyouyu32 commented 2 years ago

您好,我查询了一下本校没有CCDC数据库的权限,所以想请问一下如果没有CCDC的API接口,如何可以像您的例子一样展示sdf数据?

from Featurize import Coformer

c = Coformer('./Test/coformers/1983.sdf')
Saoge123 commented 2 years ago

代码里面有个ccgnet-OB文件夹,不需要CCDC,但是效果可能会有影响

yuyouyu32 commented 2 years ago

非常感谢您的回答。