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Saoge123 / ccgnet

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如何筛选出符合条件的化合物？ #7

Open chunfenghuayu1 opened 9 months ago

chunfenghuayu1 commented 9 months ago
  1. 我在源码中\data\Test\coformers中看到148个sdf文件，请教作者是如何生成sdf文件的？
  2. 请教作者，如何根据文章中的限制条件，在剑桥数据库中筛选出合适的化合物？
Saoge123 commented 9 months ago

在本地安装剑桥数据库，利用它的Python api编写脚本可以遍历整个数据库的晶体结构，并设置过滤条件，满足条件的样本可保存成sdf文件。此外也可以利用ccdc的查询程序过滤。

----------回复的邮件信息---------- @.***> 于2024年1月29日(周一) 晚上11:51写道:

我在源码中\data\Test\coformers中看到148个sdf文件，请教作者是如何生成sdf文件的？

请教作者，如何根据文章中的限制条件，在剑桥数据库中筛选出合适的化合物？

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chunfenghuayu1 commented 9 months ago

请问，您有搜索的示例嘛？

Saoge123 commented 9 months ago

您可以参考ccdc官方网站的教程

---原始邮件--- 发件人: @.> 发送时间: 2024年1月30日(周二) 晚上9:14 收件人: @.>; 抄送: @.**@.>; 主题: Re: [Saoge123/ccgnet] 如何筛选出符合条件的化合物？ (Issue #7)

请问，您有搜索的示例嘛？

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