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ShixiangWang / DoAbsolute

:package: Automate Absolute Copy Number Calling using 'ABSOLUTE' package
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Allele specific Copy number进行absolute运算 #18

Closed DrZhaoJie closed 3 years ago

ShixiangWang commented 3 years ago

补充你邮件里面发的图：

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ShixiangWang commented 3 years ago

你可以对比下包内提供的示例文件：https://github.com/ShixiangWang/DoAbsolute/blob/master/inst/extdata/SNP6_metastatic_tumor.seg.txt

基本是一一对应的，你修改下列名就好了，可以使用DoAbsolute这个包。

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ShixiangWang commented 3 years ago

你提供的截图并没有等位基因的拷贝数值（Allele-specific Copy number），seg.mean就是总拷贝。目前我看来不用在意。