Closed Sa-ku-mo closed 4 months ago
孙老师好, https://github.com/SunPengChuan/wgdi-example/blob/main/Karyotype_Evolution.md 的教程中提到,用_T. sinense_映射到AEK上,并依次使用-icl -bi -c -bk得到如下的ks图,#45 中也展示了类似的图片 但-bi需要ks文件作为输入,而-ks分析需要物种的cds文件,组装得到的祖先只有蛋白质序列,请问这一步应当如何复现呢?
ks=none
感谢您的解答
孙老师好, https://github.com/SunPengChuan/wgdi-example/blob/main/Karyotype_Evolution.md 的教程中提到,用_T. sinense_映射到AEK上,并依次使用-icl -bi -c -bk得到如下的ks图,#45 中也展示了类似的图片
但-bi需要ks文件作为输入,而-ks分析需要物种的cds文件,组装得到的祖先只有蛋白质序列,请问这一步应当如何复现呢?