如何保存DNN_model训练完毕之后的marker_genes？

[UnseenAnchor]

在利用scRNA训练完dnn model之后，需要保存checkpoint，我看您保存了model optimizer epoch train_loss valid_loss valid_metric lr best_val marker_genes label_names ，这其中marker_genes 是如何筛选出来保存的呢？

[SilversH]

你好，感谢对我们工作的关注。这部分可以使用scRNA数据的全部基因（或和空间组的交集部分），如果有例如需要使用部分marker的先验也可以取对应部分的marker。根据我们的测试，在大部分情况下使用scRNA数据的全部基因已经能获得很好的效果。