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TheoreticalEcology / EcoPhyloSim

R package for simulation of biogeographical and phylogenetic data
http://theoreticalecology.github.io/EcoPhyloSim/
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Check localPlots function #65

Closed florianhartig closed 8 years ago

florianhartig commented 8 years ago

Ich habe die localPlots Funktion etwas erweitert und den Code aufgeräumt, siehe https://github.com/biometry/phylosim/commit/2742f3a3a33b4c3a7dd864180c58b31b82c0854d

Dabei ist mir ein paar komische Sachen aufgefallen - warum ist da das -1 in

seq(y,y+edge)-1

Kannst du mal schauen ob da alles korrekt implementiert ist. Gut wäre auch wenn man sich das mal graphisch anschauen könnte - gab es da nicht mal eine Funktion für?

florianhartig commented 8 years ago

Kannst du verbinden mit https://github.com/biometry/phylosim/issues/59

stefan-paul commented 8 years ago

Ich weiß nicht wofür das -1 gedacht war. Es ist in der Funktion auch nicht nötig, da man auf Grund der Abfrage sowieso nicht außerhalb des Grids landen kann. Ich habe zudem noch eine simple Plotfunktion hinzugefügt. Das Argument plot=T zeigt nun an wo die subplots in der Matrix liegen. Hab auch hier die Änderungen im branch gemacht. Wird ja sowieso bald zusammengeführt.