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WAMAWAMA / TNSCUI2020-Seg-Rank1st

This is the source code of the 1st place solution for segmentation task in MICCAI 2020 TN-SCUI challenge.
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关于step1中使用自己数据集的问题 #28

Closed over-star closed 3 years ago

over-star commented 3 years ago

csv中数据如下： 截图_20215302105359 当我运行step1_preprocessing.m文件报错： 截图_20215502105521 运行到第二条数据没有gt框的数据报错，第一条有mask是正常的 请问使用自定义数据集有什么注意的吗？

WAMAWAMA commented 3 years ago

1）如果某些数据没有对应的GT的话，你可以做一个空图GT，来保证预处理正常进行 2）没有GT的数据，全监督也不能用来训练，如果你单纯想测试，可以先不管这些无GT的数据，最后step3进行推理的时候会自动预处理的 3）自定义数据集可以参考demo 数据集-DDTI数据集，没有特殊需要注意的，但是如果命名是非数字的，那么就需要参考这个issue👉 #27 4）actually，预处理这一步其实可有可无，如果你的数据没有背景，那么也不需要运行这一步

over-star commented 3 years ago

谢谢你的回复。 源数据本身是有全黑空图GT，但是运行就会报错。 截图_20211402111409 我仔细对比了和DDTI数据集差异，只是数据像素不一样，DDTI是560360，我是256256

over-star commented 3 years ago

我猜测可能是对于没有mask的图片.m文件没有自动判断，需要手动处理哇

WAMAWAMA commented 3 years ago

mask图片如果是空，确实会影响预处理在这一行代码 这个我之前疏忽了 所以不要把无GT的样本的mask赋值空矩阵，可以赋值为全为1，应该就可以了👍