search

Wytamma / snk

Snakemake workflow management system and CLI generation tool
https://snk.wytamma.com
MIT License
31 stars 2 forks source link

Print snake help fails on v8 #71

Closed Wytamma closed 6 months ago

Wytamma commented 6 months ago 
│ nds/run.py:70 in _print_snakemake_help                                                           │
│                                                                                                  │
│    67 │   │   if value:                                                                          │
│    68 │   │   │   import snakemake                                                               │
│    69 │   │   │                                                                                  │
│ ❱  70 │   │   │   snakemake.main("-h")                                                           │
│    71 │                                                                                          │
│    72 │   def run(                                                                               │
│    73 │   │   self,                                                                              │
│                                                                                                  │
│ ╭─────────────────────────────────────────── locals ───────────────────────────────────────────╮ │
│ │ snakemake = <module 'snakemake' from '/Users/wwirth/Library/Application                      │ │
│ │             Support/hatch/env/virtual/unitigs/Gd9hFHDM/unitigs/lib/python3.12/site-packages… │ │
│ │     value = True                                                                             │ │
│ ╰──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╯ │
╰──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╯
AttributeError: module 'snakemake' has no attribute 'main'

Can use workflow --snake--help as workaround.