search

YaoZhang93 / mmFormer

[MICCAI 2022] The official code for "mmFormer: Multimodal Medical Transformer for Incomplete Multimodal Learning of Brain Tumor Segmentation"
Apache License 2.0
101 stars 12 forks source link

标签和预测结果可视化 #20

Open Deer231 opened 3 months ago

Deer231 commented 3 months ago

作者您好，我想请教您论文中的标签和预测结果可视化是怎么做的呢，是用哪些数据和方法进行可视化的呢

YaoZhang93 commented 3 months ago

数据就是划分的测试集，用ITKSnap可视化

Deer231 commented 3 months ago

数据集是处理后的.npy格式，那么这样每个样本的图片尺寸和切片数是不是都不一样呢，请问您是在predict.py中保存预测结果为nii.gz格式嘛，这样的话怎么可以确保保存的预测结果和数据集.npy格式的标签和MRI图像对应呢，您是否能提供一下您保存预测结果的代码嘛

YaoZhang93 commented 3 months ago

我理解您的意思了，论文里是直接读取的npy然后用matplotlib可视化的。如果您想要还原图像然后用itksnap可视化，可以参考这个 #12

Deer231 commented 3 months ago

好的好的，非常感谢你的回答。