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YuLab-SMU / enrichplot

Visualization of Functional Enrichment Result
https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/
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关于barplot #135

Open zulinwu opened 3 years ago

zulinwu commented 3 years ago

在barplot代码中，为什么要使用df <- fortify(object, showCategory=showCategory, by=x, ...)这一步呢，为什么不直接使用object@result呢？希望大神可以帮忙解答疑惑，因为我在实际使用中发现在经过上面代码后得到的结果数量变少了（行变少），比如我showCategory设置为15，则结果只有13

GuangchuangYu commented 3 years ago

没有可重复性例子，说啥都没用。

zulinwu commented 3 years ago

作为一个新手，我不太理解这里使用的fortify函数，获取object对象的data frame不是可以直接使用object@result，然后再添加条件。谢谢！