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ZZCrazy00 / DPI

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在运行main.py的时候产生了一个bug #1

Open wpy297 opened 3 months ago

wpy297 commented 3 months ago

bug的具体细节如下： python main.py 664 445 2926 SP 0%| | 0/1000 [00:04<?, ?it/s] Traceback (most recent call last): File "/home/wupeiyuan/AI_Test2024/DPI/main.py", line 46, in result = train_func(args, train_loader, val_loader, test_loader, model, optimizer, loss_fn) File "/home/wupeiyuan/AI_Test2024/DPI/utile.py", line 151, in train_func result = test_model(test_loader, model) File "/home/wupeiyuan/anaconda3/envs/myenv1/lib/python3.9/site-packages/torch/autograd/grad_mode.py", line 27, in decorate_context return func(*args, *kwargs) File "/home/wupeiyuan/AI_Test2024/DPI/utile.py", line 127, in test_model logits = model(data, sample_indices, links, indices, target='test') File "/home/wupeiyuan/anaconda3/envs/myenv1/lib/python3.9/site-packages/torch/nn/modules/module.py", line 1130, in _call_impl return forward_call(input, **kwargs) TypeError: forward() got an unexpected keyword argument 'target'

修改这个参数相关内容又会触发早停机制，想请教一下这一部分，谢谢！

ZZCrazy00 commented 3 months ago

logits = model(data, sample_indices, links, indices) 抱歉，上传代码时没检查仔细，去掉target这个参数就好。 关于早停机制，我不太明白你的问题。

wpy297 commented 3 months ago

是这样的，我尝试过去掉target这个参数，但是去掉这个参数之后，到第10个epoch就退出训练了，也就是说这连续的10个epoch并没有改善。所以我想问一下是不是别的地方还有什么问题我没有注意到.

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: @.>; 发送时间: 2024年5月28日(星期二) 上午10:34 收件人: @.>; 抄送: @.>; @.>; 主题: Re: [ZZCrazy00/DPI] 在运行main.py的时候产生了一个bug (Issue #1)

logits = model(data, sample_indices, links, indices) 抱歉，上传代码时没检查仔细，去掉target这个参数就好。 关于早停机制，我不太明白你的问题。

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ZZCrazy00 commented 3 months ago

因为early_stop这个参数设置的是10，你可以打印看看每轮的测试结果，或者把early_stop设置的更大点

wpy297 commented 3 months ago

我懂了，谢谢你的回答

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: @.>; 发送时间: 2024年5月28日(星期二) 中午11:04 收件人: @.>; 抄送: @.>; @.>; 主题: Re: [ZZCrazy00/DPI] 在运行main.py的时候产生了一个bug (Issue #1)

因为early_stop这个参数设置的是10，你可以打印看看每轮的测试结果，或者把early_stop设置的更大点

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wpy297 commented 2 months ago

main.py中： parser.add_argument('--dataset_name', type=str, default='davis', choices=['BindingDB', 'davis', 'enzyme', 'gpcr', 'ic', 'nr']) parser.add_argument('--num_test', type=float, default=0.2, help='ratio of test datasets') parser.add_argument('--ratio', type=float, default=1, help='ratio of positive samples and negative samples') parser.add_argument('--task', type=str, default='SD', choices=['SD', 'ST', 'SP']) 时，运行产生bug： Traceback (most recent call last): File "/home/wupeiyuan/AI_Test2024/DPI/main.py", line 64, in print_result(all_result) File "/home/wupeiyuan/AI_Test2024/DPI/main.py", line 54, in print_result metric_values[j].append(float(val[-6:])) ValueError: could not convert string to float: 'cc:nan' 同时在ic-SD、davis-ST、ic-ST这几种情况下也产生了同样的bug。