Ziyan-Huang / FLARE22

Champion Solution of MICCAI FLARE22 Challenge and FLARE24 Task2 Challenge based on nnU-Net.
Apache License 2.0
62 stars 7 forks source link

关于Grand Challenge上MSD验证集提交问题 #2

Closed LinxuanHan closed 1 year ago

LinxuanHan commented 1 year ago

大佬您好: 我是华中科技大学计算机专业的一名本科生,很抱歉以这种形式联系您。 我正在MSD上提交验证集,但是出现了这样的问题: evalutils.exceptions.FileLoaderError: Could not load and files in /input/Task01_BrainTumour with <evalutils.io.SimpleITKLoader object at 0x7fedc5ae6cf8>. 可是,我提交的预测标签都是nii.gz的文件,还是出现上述错误,不知道是什么原因。 由于您在提交榜单上有靠前排名,所以想请教您,您提交的文件是如何保存提交的。还望您能够予以指教,不胜感激。

2023年4月5日

Ziyan-Huang commented 1 year ago

同学你好, 可以先检查一下你提交的压缩文件是否是这个格式: image 我先猜测你提交的文件里没有 Task01_BrainTumour 这个文件夹。注意名字是否一致。

LinxuanHan commented 1 year ago

大佬您好: 是这样的,我只进行了脑肿瘤分割的模型训练和验证集结果输出,我的提交结果是这样的:

按照您的意思,是不是需要十项内容全部放入,才能有效进行呢?

 

浑水 @.***

 

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "ziyan @.>; 发送时间: 2023年4月5日(星期三) 晚上6:46 收件人: @.>; 抄送: @.>; @.>; 主题: Re: [Ziyan-Huang/FLARE22] 关于Grand Challenge上MSD验证集提交问题 (Issue #2)

同学你好, 可以先检查一下你提交的压缩文件是否是这个格式:

我先猜测你提交的文件里没有 Task01_BrainTumour 这个文件夹。注意名字是否一致。

— Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. You are receiving this because you authored the thread.Message ID: @.***>

LinxuanHan commented 1 year ago

大佬您好: 是这样的,我只进行了脑肿瘤分割的模型训练和验证集结果输出,我的提交结果是这样的: image image

按照您的意思,是不是需要十项内容全部放入,才能有效进行呢?

Ziyan-Huang commented 1 year ago

可以先试一下你的结果,能否用 SimpleITK 顺利读取。 另外 MSD 可能确实是需要十项内容全部放入(我自己是这样提交的),如果只想测试 Task01 的结果,其它的可以先随意预测一些结果一起交了。

LinxuanHan commented 1 year ago

大佬您好,文件读入错误的问题解决了,但是奇怪的问题又增加了。 我在代码里生成对应尺寸的label后提交, image 出现了,OOM的问题, image 根据提交规则,已经明确的更改格式为uint8,并且不是全0数组,而且,每个Label的大小都在200KB以内,很难想象这是什么原因,请问您在提交过程中有遇到过相似问题么? 再次感谢您不厌其烦的予以解答。

LinxuanHan commented 1 year ago

我也十分仔细的检查过了每个文件夹下文件的个数,也是和其他人提交文件的个数是相同的

LinxuanHan commented 1 year ago

啊,不幸地,我刚才提交了一版一摸一样的,竟然成功提交了,我要崩溃了。:(