L'outil n'est plus dépendant de l'assembleur. Auparavant, les fichiers d'entrée devaient tous provenir de Trinity, ou tous provenir de Velvet Oases. Désormais, l'outil fonctionne avec des fichiers d'entrée pouvant provenir de l'un ou l'autre assembleur.
! A considérer :
Le script se base désormais sur le format du premier header de chaque fichier d'entrée pour déterminer de quel assembleur il provient.
Si le header commence par ">Locus" alors les transcrits ont été assemblés par VelvetOases
Si le header commence par ">c" alors les transcrits ont été assemblés par Trinity.
L'outil détermine en focntion quel code appliquer
Il faut donc être certain que tous les fichiers d'entrée utilisés à l'avenir auront ce format. Didier a dit que tous les transcriptomes dont l'équipe dispose sont formatés ainsi.
L'outil n'est plus dépendant de l'assembleur. Auparavant, les fichiers d'entrée devaient tous provenir de Trinity, ou tous provenir de Velvet Oases. Désormais, l'outil fonctionne avec des fichiers d'entrée pouvant provenir de l'un ou l'autre assembleur.
! A considérer : Le script se base désormais sur le format du premier header de chaque fichier d'entrée pour déterminer de quel assembleur il provient.