Modification de CDS_Search pour ne pas dépendre des noms des fichiers d'entrées (des modifications en amont dans le pipeline ont conduit à des noms de fichiers différents en sortie de POGs et BlastALign, causant un crash de CDS_search)
Tests fonctionnels de CDS_Search : ajout de nouveaux fichiers + conservation des tests d'origine (les fichiers de tests d'origine ont été renommés en accord avec les modifs, mais leur contenu n'a pas été modifié pour s'assurer de l'intégrité des tests).
A priori, les briques suivantes (ConcatPhyl, MutCount) n'ont pas besoin d'êtres mofidiées.
Modification de CDS_Search pour ne pas dépendre des noms des fichiers d'entrées (des modifications en amont dans le pipeline ont conduit à des noms de fichiers différents en sortie de POGs et BlastALign, causant un crash de CDS_search)
Tests fonctionnels de CDS_Search : ajout de nouveaux fichiers + conservation des tests d'origine (les fichiers de tests d'origine ont été renommés en accord avec les modifs, mais leur contenu n'a pas été modifié pour s'assurer de l'intégrité des tests).
A priori, les briques suivantes (ConcatPhyl, MutCount) n'ont pas besoin d'êtres mofidiées.