Add ecological apriori - Githubissues

abims-sbr / adaptsearch

A pipeline for the search of adaptive mutations and positively selected genes from RNASeq orthologs

http://www.sb-roscoff.fr/fr/equipe-adaptation-et-biologie-des-invertebres-en-conditions-extremes

GNU General Public License v3.0

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Add ecological apriori #44

Closed Mataivic closed 5 years ago

Mataivic commented 6 years ago

Replaced 'MutCount separated mode' scripts by a re-implementation of Eric's scripts Ecological_apriori'
The scripts does exactly the same thing than before, but with binomial sign tests afterwards (also, csv outputs files are organized differently)

Mataivic commented 6 years ago

Remarque : les tests Travis peuvent rater car > 50min.

Mataivic commented 6 years ago

La série des 5 derniers petits commit, c'est essentiellement des corrections d'erreurs de typo (plusieurs commits au lieu d'un seul car j'éditais le fichier directement depuis GitHub et je n'ai pas repéré toutes les erreurs en une seule fois).

lecorguille commented 5 years ago

@Mataivic Tu as résolu le conflict ? Cool, merci !

Mataivic commented 5 years ago

@lecorguille Oui, mais le test Travis s'est mis en "errored" car il a dépassé 50min !

lecorguille commented 5 years ago

GREEEN

lecorguille commented 5 years ago

Je merge ?

Mataivic commented 5 years ago

@lecorguille Oui tu peux merger !