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agroportal / project-management

Repository used to consolidate documentation about the AgroPortal project and track content related issues.
http://agroportal.lirmm.fr
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pb loading thesaurus DATA4CPLUS #225

Closed saubin78 closed 2 years ago

saubin78 commented 2 years ago

Hi, Julien has loaded a new version of http://agroportal.lirmm.fr/ontologies/DATA4CPLUS but the parsing has failed again. Can you send me the logs please ?

jonquet commented 2 years ago

Hello. Il y pas de log significatif coté AgroPortal car le fichier ne parse pas. Cela n'a pas l'air d'etre du RDF/XML valide

Voila la 1ere erreur de Protégé :

image

Et les lignes correspondantes:

image

Le dernier fichier uploadé peut être récupéré avec : http://data.agroportal.lirmm.fr/ontologies/DATA4CPLUS/submissions/1/download?apikey=2ae6878b-a599-4cee-8224-e8efaf6f610e

saubin78 commented 2 years ago

Bonjour, le fichier est chargé et on peut visualiser l'arborescence. Par contre, quand on clique sur un concept, un message d'erreur s'affiche : image Je ne comprends pas de quoi il s'agit.

Sophie

syphax-bouazzouni commented 2 years ago

Bonjour,

Merci d’avoir soulevé ce problème, c’est pas lié a votre ressource mais plus un bug chez nous.

Nous allons le corriger au plus vite,

A suivre ici https://github.com/ontoportal-lirmm/bioportal_web_ui/issues/65

syphax-bouazzouni commented 2 years ago

Re bonjour @saubin78,

  1. J'ai fait un hotfix pour ne plus etre spammer par l'alert de datatables (https://github.com/ontoportal-lirmm/bioportal_web_ui/commit/b412eba0ce456cb6b4084cdb58ebbc68f8963bac) , maintenant vous pouvez parcourir l'arborescence sans problème.
  2. Par contre j'ai toujours pas trouver la source du problème mais sûrement lié a ce que je décrit ici https://github.com/ontoportal-lirmm/bioportal_web_ui/issues/65 (le topConcept "http://data4c-plus.net/admin/thesaurus/read/0") n'est pas défini dans votre thesaurus)
  3. Améliorer notre prise en charge des ressources en SKOS fait partie de nos priorités dans les prochains mois
saubin78 commented 2 years ago

Merci Syphax. Je pense que le topConcept /read/0 est une bonne piste. La personne qui génére le fichier est en congés cette semaine. Nous referons des tests prochainement et te tiendrons au courant pour désactiver le hotfix et vérifier que tout est bon. Excellente nouvelle pour l'amélioration de la prise en charge du SKOS. Vous pouvez compter sur nous pour tester :-)

jonquet commented 2 years ago

Apres le dernier chargement du fichier le 7 mars sans le /read/0 cela semble bien indexé et il n'y a plus d'erreur.

Reste juste les metrics a relancer.

syphax-bouazzouni commented 2 years ago

J'ai relancer les metrics manuellement pour cette ressources.

Pour une raison que nous avons pas encore identifié dans certain cas les metrics ne sont pas calculer automatiquement ( suivre ici https://github.com/agroportal/documentation/issues/204) .