search

agroportal / project-management

Repository used to consolidate documentation about the AgroPortal project and track content related issues.
http://agroportal.lirmm.fr
7 stars 0 forks source link

Le chargement d'une nouvelle soumission pour CO_356 génère une erreur #503

Open jonquet opened 3 months ago

jonquet commented 3 months ago

Le chargement d'une nouvelle soumission pour CO_356 génere une erreur

Capture d’écran 2024-03-12 à 17 29 43
syphax-bouazzouni commented 1 day ago

Pour la signification de proc_naming , c’est ce message d’erreur There is already a persistent resource with id #{@id.to_s} qui n’est pas afficher car dans la nouvelle UI on affiche que les labels(keys) des erreurs.

Et vous avez eu cette erreur car cette ontologie avez deja une soumission zombie avec le meme ID, ce qui fait que vous pouviez pas faire de nouvelle soumission dans l’UI, mais que ca marche en ligne de commande.

jonquet commented 1 day ago

Ok donc après investigation il y a bien une soumssion zombie (la 42) qui empêche de mettre une nouvelle soumission.

Capture d’écran 2024-07-03 à 11 08 19

mais cela renoie rien: https://data.agroportal.lirmm.fr/ontologies/CO_356/submissions/42?display=all

On doit faire le nettoyage manuelleent. Je peux faire le repertoire sur le serveur, mais @syphax-bouazzouni pourrait tu verifier qu'il y apas de graphe zombie aussi dans le triple store ?

syphax-bouazzouni commented 21 hours ago

@jonquet, I removed submission 42, you can now create new submissions and close this issue if done.

jonquet commented 15 hours ago

Bon ok , j'ai ajouté une soumission et cela ne que partiellemnt marché. En fait, il a repris le fichier de la 41 comme fichier source. Et pas celui à la pullLocation. Bizarre.

J'ai ensuite essayé (apres le parsing qui s'est bien passé et du oup apres avoir envoyé l'email aux utilisateurs @cpommier entre autres) .. de changer via l'API les valeurs des propriétés pas mise à jour vers :
"uploadFilePath": "/srv/ontoportal/data/repository/CO_356/42/CO_356-Vitis-inra-ontology.nt", "diffFilePath": "/srv/ontoportal/data/repository/CO_356/42/bubastis_diff.xml"

Mais cela n'a pas marché. J'ai bien un 204 mais pas de changement dans le JSON. Comme vu ici: https://data.agroportal.lirmm.fr/ontologies/CO_356/submissions/42?display=uploadFilePath,diffFilePath

Donc nouvelle tentative de chargement d'une nouvelle soumission (quie devrait etre la 43) et qui je l'espere prendra le bon fichier source.