ディレクトリ構造をpyprojectに合わせ、コマンドラインから実行できるように変更しました。

[aki2274]

ディレクトリ構造を変更してpyprojectでパッケージ化をしてpip installができることを確認しました。 また、コマンドラインでKOnezumiAID ${gene_symbol or transcript name}で期待通りの動作をすることを確認できました。