aki2274 / KOnezumi-AID

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datasetの作成部分の修正 #79

Closed aki2274 closed 3 months ago

aki2274 commented 4 months ago

create_strand_plus_seq_dictの機能が複数あり、動作が遅いと感じるので改善が必要

aki2274 commented 3 months ago

bed6を作成する時点でtranscriptの重複やNR_から始まるものを除く

部分の改善ができたのでcloseします.

.upper()を行う個所をdataclassの作成の部分にする。

についてはO(N)なので影響が少ないとみて無視します.