出力の形式を整える、および可読性をあげる

[akikuno]

As Is（今の状態を記載）

いまのREADMEにある出力（一部）は以下のようになっております。

PTC gRNA
                        seq  in_start_150bp  in_50bp_from_LEJ
0   ACAGTTTGGCGGCGTTCGGGTGG            True             False
1   ACGACACAGCATCACCAGGCTGG           False             False
2   ACAGGTTATGCAGTGTCCTGTGG           False             False
Acceptor gRNA
                       seq  exon_index
0  ACCTGGGATTGAAAGGAACAAGG          20
Donor gRNA
                       seq  exon_index
0  TACCTTGCCCAAGTCCATCATGG           8

個人的には、出力のフォーマットが不定であり（TSVでもCSVでもない）、説明がやや不足していると感じます。

To Be （理想の状態を記載。タスク完了の条件にもなる。）

こちらを、例えば以下のように変更するといかがでしょうか。

- List of gRNAs to generate PTC (premature termination codon)
Target sequence (20mer + PAM), Recommendation, PTC at >150 bp after the coding start site, PTC at >50-55 nts upstream of the last exon junction
ACAGTTTGGCGGCGTTCGGGTGG, Flase, False, True
ACGACACAGCATCACCAGGCTGG, True, True, True
ACAGGTTATGCAGTGTCCTGTGG, True, True, True

- List of gRNAs to disrupt splice acceptor site
Target sequence (20mer + PAM), Exon number
ACCTGGGATTGAAAGGAACAAGG, 20

- List of gRNAs to disrupt splice donor site
Target sequence (20mer + PAM), Exon number
TACCTTGCCCAAGTCCATCATGG, 8

• 基本的にCSVになっていて、情報を切り取りやすい（Excelでも開けます）
• (PTCのところには)Recommendationをつけ、ユーザーが選びやすくします
  • 150 bp rule と 50-55 nt ruleは、PTCがNMDを起こす条件のときにTrueとしました。Trueが多いほうがRecommendされる、という自然な印象にするためです。
• 「PTC gRNA」などは正式な用語としては存在しないので、明示的にします
  • 各コラムについても、明示的にします

アクション（改善のための具体的なアクションを記載）

上記は一例ですので、滝さんの思う通りにしていただければ幸いです（別に修正が必須というわけでもありません！）

課題 （現状分かっている課題を記載）

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