aki2274 / KOnezumi-AID

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pyproject.tomlの修正 #99

Closed aki2274 closed 3 months ago

aki2274 commented 3 months ago

PyPIを通してインストールする際に pyproject.tomlに以下のような記述があると,bowtieとbedtoolsをpipインストールできなくてエラーが起こるような気がするのですがいかがでしょうか.poetryの依存関係はpipを通して解決するのだと考えていますがあっていますか?

[tool.poetry.dependencies]
python = "^3.9"
numpy = "1.26.0"  
pandas = "2.2.2"
primer3-py = "^2.0.1"
bedtools = "2.28.0"
bowtie = "1.1.2"
akikuno commented 3 months ago

そうですね、PyPIにあるパッケージをインストールするようあので、bedtoolsやbowtieは無理かと思います😅

https://python-poetry.org/docs/repositories/

bowtieについては全く違うパッケージをインストールしてしまう可能性がありますので、控えたほうが良さそうです。

https://pypi.org/project/bowtie/

aki2274 commented 3 months ago

ご確認ありがとうございます。 #102 で削除しました.

aki2274 commented 3 months ago

解決したのでcloseします