create Olympus oir reader module - Githubissues

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pipeline tool

GNU General Public License v3.0

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create Olympus oir reader module #281

Closed itutu-tienday closed 8 months ago

itutu-tienday commented 8 months ago

PR内容

Olympus OIR Readerモジュール作成

動作確認手順

データの配置
- 以下dllのローカル環境配置（任意のパス）
  - https://drive.google.com/drive/folders/1wIbYZIimjqjap0Hw_UHJYISZEEvkomgL
- 以下テスト用データのローカル環境配置（任意のパス）
  - https://drive.google.com/drive/folders/1rGd0i7aK8pTsXlwqOZ-W5SImvUsbjGIe
テストコード（test_OIRReader.py）を pytest で実行可能
- テストコード内の設定（LIBRARY_DIR, TEST_DATA_PATH）で、上で配置した dll,テスト用データ, の格納パスを指定
- テストコードは Linux/Windows の両環境で動作可能

レビュー観点

前提
- Nikon, Inscopix と比較し、Olympus の Reader Module は、プログラムコード量はやや多めとなっている（SDKに添付のC++コードを移植しているため）
- microscopes/modules/olympus 配下のモジュール群は、SDK C++コードをベースに移植しているため、仕様面の詳細レビューは任意でよい
レビュー観点
- 動作や構成が妥当であるか
- 取得画像データのWorkfllow Nodeへの投入検証

その他

関連
- Nikon PR: #248
- Inscopix PR: #257

itutu-tienday commented 8 months ago

@ReiHashimoto 当件、レビューをお願いいたします。

また当件のレビュー完了後、 feature/microscope/main → develop-main へマージ実施想定です。