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GNU General Public License v3.0
1
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3
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visualize FluoData and RoiData from hdf5 data
#292
Closed
ReiHashimoto
closed
4 months ago
ReiHashimoto
commented
4 months ago
Resolves #167
NWBのデータからFluorescence、RoiDataのプロットをvisualizeするためのノードを作成
FluoData
optinist/utils/fluo_from_hdf5のアルゴリズムで利用可能
入力
fluo: NWBのFluorescenceデータタイプのデータ
RoiData
optinist/utils/roi_from_hdf5のアルゴリズムで利用可能
入力
all_roi_img
all_roi_imgの画像データはNWBファイルの
processing/optinist
内に保存されるように実装
iscell
optional
iscellデータを付与した場合はcell_roi, non_cell_roiのプロットが追加される
Iscellなしの場合
Iscellありの場合
Resolves #167
FluoData
RoiData
processing/optinist
内に保存されるように実装Iscellなしの場合![Screenshot 2024-02-14 at 21 29 15](https://github.com/arayabrain/barebone-studio/assets/42664619/3ee9e1ad-9266-42d8-b37a-68b14eb45119)
Iscellありの場合![Screenshot 2024-02-14 at 21 30 10](https://github.com/arayabrain/barebone-studio/assets/42664619/9bd8aa6e-09f3-4d93-b799-fa862c3b8fd7)