Tools for paper reading

浏览器扩展 arxiv-utils

针对arxiv.org 网站，提供的功能主要有:

在浏览器上打开 arxiv.org 上的PDF时，自动将Tab标题改为论文标题（例如：2409.00899v2.pdf -> MarsCode Agent: AI-native Automated Bug Fixing | PDF）。这样的话，List all tabs、书签、OneTab里面都不再只是论文ID了
在 arxiv.org 页面右边侧边栏添加了一个Direct Download链接，点击时也会根据论文标题生成PDF文件名（例如2409.00899v2.pdf -> 2409.00899 v2 - MarsCode Agent, AI-native Automated Bug Fixing (Yizhou Liu et al., 2024).pdf）
- 这个文件名可以自定义，比如我设置成了 ${paperid} v${version} - ${title} (${firstAuthor} et al., ${publishedYear}).pdf
可以将 https://arxiv.org/pdf/2409.00899 这样的网址（默认是用浏览器内置的PDF阅读器打开）重定向到在线阅读器（比如 https://mozilla.github.io/pdf.js/web/viewer.html?file=https://arxiv.org/pdf/2409.00899)——需要在选项中设置PDF viewer URL prefix
- 这样做的一个好处是查词/翻译等扩展就可以用了（它们一般是不能在 file://... chrome://... 这类URL上工作的）
在摘要页(abs)和PDF阅读页面之间切换（点击这个扩展的工具栏按钮）
在 arxiv.org 页面右边侧边栏额外添加了在线阅读链接: ar5iv (HTML 5)和alphaxiv

目前我主要还是阅读PDF格式，因为HTML格式都有一些问题：

渲染问题
- arxiv.org 自己提供的HTML (experimental)（也就是 https://arxiv.org/html/2409.00899v2这样的网址）有不少渲染问题（比如一些特殊符号、表格对齐等）；而且某些论文页面没有这个HTML版本；
- ar5iv 在渲染方面会比上面这个略微好一些（也只是略微）
版本问题
- 如果一篇论文有刷新，ar5iv 只能看到 v1 版本，无法看到后续版本
- (arxiv.org 自己的HTML (experimental)页面没有这个问题)
- 引用问题
- arxiv.org 自己的HTML (experimental)页面，对于论文引用，仍然是跳到文末的出处，不容易分辨到底是哪一个（尤其是论文是分两列写的那种）
- ar5iv 比较好：改用一个小的弹出窗显示引用出处（作者、文献标题等）

而阅读PDF，我目前还是从 arxiv 页面 侧边栏跳转 到 Semantic Scholar的阅读器上去阅读：

对于引用，有一个详细的弹出框（除了文献标题、作者，还有概述），并且可以直接可以打开该文献；
Skimming Highlights: Semantic Scholar 的阅读器会用AI对论文进行一些分析，将论文中属于Goal, Method, Result的部分高亮出来。虽然不算特别准，但还是有一点辅助作用;
可以用Hypothesis 在线批注。参见Can I highlight and annotate in Semantic Reader?

之前我常用的网页批注工具是Diigo，但它在Semantic Scholar 的PDF阅读器和Mozilla的PDF阅读器上都不能工作（具体问题是后面打开时无法恢复被高亮的地方）

P.S.

如果一篇论文如果有刷新，Semantic Scholar网站上只能看到最新的版本；
如果一篇论文刷新时改了标题，它在Semantic Scholar网站就会变成多个条目，从 arxiv 网站的侧边栏链接只能跳转到最新版本对应的条目
比如 2403.06095这篇论文就有如下两个条目（但只有后可以在SS网站上在线阅读）
- RepoHyper: Better Context Retrieval Is All You Need for Repository-Level Code Completion | Semantic Scholar
- RepoHyper: Search-Expand-Refine on Semantic Graphs for Repository-Level Code Completion | Semantic Scholar