Décrire le statu quo du projet selon les problèmes de ses dépendances dures

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Description

Suite au développement de la fonctionnalité #6, les limitations de Simulation Generator (fork personnalisé), VoxSim et/ou Fiberfox sont devenues impossibles à ignorer, à contourner et à régler. Il faut alors les documenter et décrire la situation.

To do

• [x] Décrire ce qui est arrivé, le déroulement avec Simulation Generator et VoxSim.
• [x] Décrire le statu quo.
• [x] Décrire les besoins pour le futur.

Notes

Voici les notes prises lors de la réunion du mercredi 17 août 2022 :

• Futur fiberfox/voxsim/simgenerator incertain, bug ou manque de feature, ne supporte pas la division d’axone en sous-axones (1 neurone = 1 chemin), outils pour l’IRM donc calcul des trucs dont on n'a pas besoin
• Répartition de neurones intra amas avec AI + tracto dans lsm, soct,
• Configuration d’amas avec : bibliothèque de géométrie (e.g. CGAL ou jeux video) inspiré de fiberfox avec les ellipses,
• Dépôt public, python (avec dépendances bien supportées et documentées)

References

• Simulation Generator
• fork personnalisé de Simulation Generator
• MITK Diffusion (Fiberfox)

Dependencies

• Depends on #6
• Depends on #64 closes #62

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This PR/issue depends on:

• benoit-dubreuil/inm5803-ete2022#6
• benoit-dubreuil/inm5803-ete2022#64 By Dependent Issues (🤖). Happy coding!