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Implementar a possibilidade de busca por código CID-x #2

Closed heitorbarbieri closed 6 years ago

heitorbarbieri commented 7 years ago

Atualmente a busca por código somente permite o uso de código Mesh, deve-se dar também a opção pelo uso de código CID-9 e CID-10.

heitorbarbieri commented 6 years ago

@renatomurasaki ,

Precisamos conversar sobre a qualidade dos possíveis documentos recuperados dado um código CID10 fornecido. Quando o usuário entra com o código 'Z90' do CID10, o sistema tenta encontrar um código semelhante no MeSH. Como não encontra, o que resta fazer é uma busca com o texto que define o 'Z90', que é: "Acquired absence of organs, not elsewhere classified".

1) Procurando no portal por "acquired absence of organs, not elsewhere classified"" -> nenhum documento encontrado

2) Procurando no portal por "acquired absence of organs" -> 183 documentos encontrados -> títulos dos 4 primeiros da lista: a) Cross-Tissue Transcriptomic Analysis of Human Secondary Lymphoid Organ-Residing ILC3s Reveals a Quiescent State in the Absence of Inflammation. b) Unsuspected human immunodeficiency virus infection presenting as immunoglobulin G4-related lymphadenopathy: a case report. c) Zebra Fish Lacking Adaptive Immunity Acquire an Antiviral Alert State Characterized by Upregulated Gene Expression of Apoptosis, Multigene Families, and Interferon-Related Genes. d) Comparative studies of oxaliplatin-based platinum(iv) complexes in different in vitro and in vivo tumor models.

3) Procurando no portal por "acquired OR absence OR organs" -> 1.272.928 documentos encontrados -> títulos dos 4 primeiros da lista: a) Infecções comunitárias do trato urinário em Divinópolis, MG: avaliação do perfil de resistência bacteriana e do manejo clínico / Infecciones del tracto urinário adquiridas en la comunidad en Divinópolis, Brasil: evaluación del perfil de la resistencia bacteriana y la gestión clínica / Community-acquired urinary tract infections in Divinópolis, Brazil: assesment of bacterial resistance profile and clinical management b) El valor del Instrumento Diagnóstico de la Complejidad en Cuidados Paliativos para identificar la complejidad en pacientes tributarios de cuidados paliativos / The value of the Diagnostic Tool for Complexity in Palliative Care for the assessment of palliative patients
c) Discapacidad laboral auto-percibida en trabajadores de un centro de educación especial / Self-Perceived work disability in a school of children with special needs d) Miopatía de depósito de nemalina y artrogriposis congénita / Nemaline myopathy and congenital arthrogryposis

4) Procurando no serviço de documentos similares por "acquired absence of organs, not elsewhere classified" -> pelo menos os 6 primeiros documentos recuperados tem todos ou quase todos os ngramas presentes no texto de pesquisa -> títulos dos 4 primeiros da lista: a) Malignancies in the acquired immunodeficiency syndrome. b) Chimaeric mice with disruption of the gene coding for phosphatidylinositol glycan class A (Pig-a) were defective in embryogenesis and spermatogenesis. c) Intravital imaging of the mouse thymus using 2-photon Microscopy. d) Pathogenesis, clinical features, and treatment advances in mastocytosis.

renatomurasaki commented 6 years ago

@heitorbarbieri dos cenários descritos, o melhor é o 2. O InfoButton precisa ser preciso. Um algoritmo baseado na construção de estratégias de busca seria:

  1. Busca o conceito (uma ou mais palavras) no índice permutado do DeCS
  2. Encontrando, utilizar mh:, como também combinar com ti: por conta dos documentos ainda não indexados (mais recentes)
  3. Não existinho, buscar no ti: e tentar garimpar os descritores utilizados na indexação destes documentos recuperados pelo título
  4. Sair com uma estratégia de busca no seguinte estilo: (mh: ...) or (ti: ...)
heitorbarbieri commented 6 years ago

@renatomurasaki realizaremos uma reunião comigo, Arthur e @falbrito para discutirmos sobre a estrutura da base de dados Isis de conversão entre thesauri através do UMLS.

heitorbarbieri commented 6 years ago

Sobre a estratégia de busca, a tarefa segue no issue #21

heitorbarbieri commented 6 years ago

Da reunião acima citada, obteve-se a indicação de como utilizar uma base de conversão. Veja issue #24