new features tracking

[hugofluhr]

here is the list of the features requested in #25 to keep track of progress.

Filament

• [x] Filament BoundingBoxOO Length A
• [x] Filament BoundingBoxOO Length B
• [x] Filament BoundingBoxOO Length C
• [x] Filament Full Branch Depth
• [x] Filament Length (sum)
• [x] Filament Full Branch Level
• [x] Filament No. Dendrite Branch Points
• [ ] Filament No. Dendrite Branch Points Apical
• [ ] Filament No. Dendrite Branch Points Basal
• [ ] Filament No. Dendrite Branches

Totals

• [x] Total Number of Filaments
• [x] Total Number of Filaments Apical
• [x] Total Number of Filaments Basal

Dendrites

• [x] Dendrite Branch Depth
• [x] Dendrite Straightness
• [x] Dendrite Straightness Apical
• [x] Dendrite Straightness Basal
• [x] Dendrite Branching Angle B
• [x] Dendrite Branching Angle B Apical
• [x] Dendrite Branching Angle B Basal
• [x] Dendrite Branching Angle
• [x] Dendrite Branching Angle Apical
• [x] Dendrite Branching Angle Basal
• [ ] Pt Branching Angle Type=Dendrite Branch


[clothilde-ferreira]

hello petite question tu peux faire un ratio apical versus basal pour certain feature ?

Total Number of Filaments Filament Length (sum) Filament Full Branch Level Dendrite Straightness

je sais pas si cest facile ou non a faire dit moi

[acionca]

Hello,

J'ai ajouté le calcul de certain ratio dans une nouvelle pull request #29

Ensuite, en ce qui concerne les anciennes features:

• Filament No. Dendrite Branch Points Apical et Basal
  • Malheureusement, ces features ne sont présentes que en format global. Néanmoins, des informations sur le nombre de branches sont présente dans les features Level et Depth.
• Filament No. Dendrite Branches
  • Si on considère le nombre de branche tel quel, n'est-ce pas la même chose que le nombre de filaments total moins le nombre de filaments de niveau1 (sortant du soma) ? Si c'est le cas, on peut facilement rajouter cette feature.
• Pt Branching Angle Type=Dendrite Branch

  • Je ne suis toujours pas au claire sur cette feature. Le titre décrit Pt Branching Angle Type alors que les valeurs ne sont que des Pt Branching Angle et je ne vois aucune correspondances avec les features de Branching Angle classiques.