briannededeugd / BrassiToL

This is the repository for the BrassiToL project for project partner Naturalis, during the Information Design minor at AUAS.
https://brassitol.vercel.app
Other
2 stars 0 forks source link

Correct and add the links to species pages in popups #24

Open KPHendriks opened 1 month ago

KPHendriks commented 1 month ago

Ik zou onderin de popup paar linkjes maken naar: POWO, BrassiBase, iNat, en de ruwe seq data (meestal op NCBI SRA); het werkt fijnst als een link opent in een nieuwe tab/venster, zodat de gefilterde ToL ook intact blijft.

In de metadata file staan de juiste codes om te linken naar POWO en iNat.

Linken naar BrassiBase gaat via een URL die de genus en soortnaam bevat. Kijk maar eens hier naar:https://brassibase.cos.uni-heidelberg.de/?action=search&subaction=tax&param1=Camelineae/Arabidopsis%20thaliana

Dat "Camelineae" is de tribusnaam, maar linken zónder werkt ook. Beter om zonder te linken, want best veel soorten zijn sinds BrassiBase werd gebouwd naar een andere tribus 'verplaatst' (door nieuwe taxonomische inzichten).

Linken naar NCBI SRA kan met de code ("accession") in de kolom "NCBI_SRA_ID". Zie bijv. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/?term=SRR22519665 Dat "SRR22519665" is een accession zoals ik die in de metadata file gegeven heb.