cbddobvyz / digitaleye-mammography

Digital Eye for Mammography Toolkit and Benchmark
https://cbddo.gov.tr/en/projects/digital-eye-project/
GNU General Public License v3.0
60 stars 6 forks source link

CBIS-DDSM dataset preprocessing problem #4

Open erencsknn opened 1 month ago

erencsknn commented 1 month ago

CBIS-DDSM datasetinde segmentasyon projesi geliştiriyorum ve digital-eye projesinin preprocessing adımlarını uyguladıktan sonra orijinal görüntüler ile ROI'ler arasında eşleşme sorunları yaşadım. Orijinal görüntülere yaptığım dönüşüm ve ölçeklendirme işlemleri, ROI maskeleri ile uyumsuz hale geliyor.

Hem orijinal görüntülere hem de ROI maskelerine preprocessing uygulamam gerekiyor mu? Bu konuda önerilerinizi almak istiyorum. Teşekkürler!

RamazanRt commented 1 month ago

@erencsknn merhaba. Digital Eye - Mammography projesi nesne tespiti görevini yerine getiren bir proje olup, CBIS-DDSM veriseti üzerinde örnek olması için hazırlanan kodlar da nesne tespitine yönelik ön işleme adımlarını içermektedir. Eğer projeniz segmentasyon projesi ise ön işleme aşamalarında repoda verilen kodları kullanmanız çeşitli sorunlara sebep olabilir.

Eğer projenizde görüntü boyutları ile alakalı bir işlem yapılıyorsa (resize, crop vs.) ROI bilgisini içeren görüntüler içerisinde de aynı işlemi gerçekleştirmeniz gerekmektedir. Ayrıca CBIS-DDSM verisetinde maske boyutları ile görüntü boyutlarının eşleşmediği veriler de mevcut olup bu verileri filtrelemeniz gerekmektedir.

github-actions[bot] commented 1 week ago

Merhaba, Bu konunun son zamanlarda herhangi bir etkinlik içermediğini ve yakında otomatik olarak kapatılabileceğini size hatırlatmak istedik, ancak gerektiğinde bu konuyu yeniden açabilirsiniz. Proje ile ilgili farklı soru ve önerileriniz için yeni konular(issue) oluşturabilirsiniz. Digital Eye Mammography projesine ve sağlıkta yapay zekâ çalışmalarına katkılarınız için teşekkür ederiz.