chenaoki / elecpy

Simulation of electrophysiology on Python
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add test file for monodomain elecpy #5

Closed HiroshiSeno closed 5 years ago

HiroshiSeno commented 5 years ago

このモノドメインモデルをテストしたところ, タイムステップは通電刺激シミュレーション時で0.001ms, それ以外では0.005ms程に変更可能. タイムステップをそれ以上(0.01msとか)にすると計算が発散したことを確認.

chenaoki commented 5 years ago

下記のanisotropy_ratioは「心臓のフィジオーム」中のmuだと思うけど,p175の定義ではsigma_i = mu * sigma_eとなっているので定義が違うのでは?

anisotropy_ratio = sigma_l_i / sigma_t_i
rhs_vmem += anisotropy_ratio * i_ext_e
rhs_vmem *= 1 / (1 + anisotropy_ratio)