chentianlu / 3Mcor

R-Metabolome-Microbiome-Meta Data Correlation Analysis
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still running #2

Open 1Wang1999 opened 2 years ago

1Wang1999 commented 2 years ago

尊敬的老师: 您好! 我输出的结果压缩包要么只有预处理的结果,即两个excel文件;要么显示一直在运行。不知道出现了什么问题,烦请您解答。多有叨扰。 ![Uploading image.png…]()

chentianlu commented 2 years ago

你好。 感觉是你的数据有一定特殊性,程序未兼容。请告知你的项目信息(自动生成的查看结果的链接)或者直接提供部分脱敏的数据。我们尽快定位问题并给出解决方案。

----- 原始邮件 ----- 发件人: "1Wang1999" @.> 收件人: "chentianlu/3Mcor" @.> 抄送: "Subscribed" @.***> 发送时间: 星期二, 2021年 12 月 07日 下午 7:49:21 主题: [chentianlu/3Mcor] still running (Issue #2)

尊敬的老师: 您好! 我输出的结果压缩包要么只有预处理的结果,即两个excel文件;要么显示一直在运行。不知道出现了什么问题,烦请您解答。多有叨扰。 ![Uploading image.png…]()

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1Wang1999 commented 2 years ago

http://3mcor.cn/task_file/task_20211207233132/task_20211207233132_results.html 感谢您,麻烦了。

chentianlu commented 2 years ago

您的数据文件名是中文的,运行中会有些影响。 另外,数据不符合CCA和ICA等方法的要求,部分global(L1)的关联分析无法完成。L2和L3的分析是可以做的。 由于对单一用户内存的限制,过大的数据量可能也无法顺利运行。我们正在扩展内存。

你可以自己修改数据继续尝试。也可以把主要要求和希望的参数告知我们,我们后台帮你运行给你结果。

Tianlu Chen

@.***

From: 1Wang1999 Date: 2021-12-08 14:31 To: chentianlu/3Mcor CC: Tianlu Chen; Comment Subject: Re: [chentianlu/3Mcor] still running (Issue #2) http://3mcor.cn/task_file/task_20211207233132/task_20211207233132_results.html 感谢您,麻烦了。 — You are receiving this because you commented. Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. Triage notifications on the go with GitHub Mobile for iOS or Android.

1Wang1999 commented 2 years ago
尊敬的老师您好: Global correlation
想做PA和O2PLS的关联分析,不加表型。 Hierarchical correlation
想做WGCNA的降维方法,把和表型-SUA相关的差异代谢物和代谢菌筛选出来,做Spearman关联分析。 Pairwise correlation

想做Gramm的关联,不加表型。r的临界值是0.4或者0.5。 不知我是否还有表达不清楚之处,万分感谢。 诚盼您拔冗回复

顺致冬安

                                                                                                               王若愚
                                                                                                       2021年12月9日
王若愚

@. | 签名由网易邮箱大师定制 On 12/9/2021 11:40,Tianlu @.> wrote:

您的数据文件名是中文的,运行中会有些影响。 另外,数据不符合CCA和ICA等方法的要求,部分global(L1)的关联分析无法完成。L2和L3的分析是可以做的。 由于对单一用户内存的限制,过大的数据量可能也无法顺利运行。我们正在扩展内存。

你可以自己修改数据继续尝试。也可以把主要要求和希望的参数告知我们,我们后台帮你运行给你结果。

Tianlu Chen

@.***

From: 1Wang1999 Date: 2021-12-08 14:31 To: chentianlu/3Mcor CC: Tianlu Chen; Comment Subject: Re: [chentianlu/3Mcor] still running (Issue #2) http://3mcor.cn/task_file/task_20211207233132/task_20211207233132_results.html 感谢您,麻烦了。 — You are receiving this because you commented. Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. Triage notifications on the go with GitHub Mobile for iOS or Android.

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