cjvanlissa / gorica

Informative hypothesis testing using generalized AIC
0 stars 3 forks source link

Output: relative weigth (zie comment) #23

Closed rebeccakuiper closed 4 years ago

rebeccakuiper commented 5 years ago

Ook een matrix maken (van relative weights) zoals bain met BFmatrix. Dat evt alleen opvraagbaar, maar mag ook standaard output zijn.

Evt mbt "Ik wil bijv, als lik = max lik is, aangeven wat max relative weight is of zeggen dat er nu een max is tov hypo’s met zelfde lik.": Dan in rel weight matrix aangeven welke hun max hebben (nl als gelijke LL, dus ook als twee gelijk hebben maar ll niet max is).

rebeccakuiper commented 5 years ago

my_gorica <- gorica(fit.lm, HypoSet)

STEL weights opvraagbaar met "my_gorica$gorica_weights". Dan:

relative weight H2 vs H1

my_gorica$gorica_weights[2] / my_gorica$gorica_weights[1]

Ik zou dat voor alle hypotheses willen (als een set van hypotheses), zoals ook BFmatrix in bain.

NB Als complement & meerdere hypotheses (kan nu nog niet) dan alleen weights tov eigen complement en niet ook zo'n rel.weights.matrix ovs die weights.

rebeccakuiper commented 5 years ago

Dit was gelijk aan #7 (die sluit ik dan).

Comment daar: Laten we ook rel weights zien (ook tov complement)? Ws niet, ms ook een mx maken zoals bain met BF. Dan daar aangeven welke hun max hebben (nl als gelijke LL, dus ook als twee gelijk hebben maar LL niet max is).

cjvanlissa commented 5 years ago

Is de berekening correct?

loglik %% t(1/loglik) / penalty %% t(1/penalty)

rebeccakuiper commented 5 years ago

Ik zou zeggen dat je er met nu al berekende gorica weights er het snelst komt... dus dan heb je loglik en penalty niet meer nodig.

gorica.weights %*% t(1/gorica.weights)

rebeccakuiper commented 5 years ago

Nb Dan heb je de relative weight van H{rij} versus H{column}. Wellicht is het handig om dan bij de rijen gewoon de H_m's te noemen en dan bij de kolommen niet de H_m's maar "versus H_m"'s, las je snapt wat ik bedoel... Dus de output ziet er dan bijv zo uit: vs H1 vs H2 vs Hu H1 1 0.333 0.167 H2 3 1 0.500 Hu 6 2 1