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MateriApps LIVE! User Forum
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MateriApps LIVE! 2.0 ベータテスト #8

Closed wistaria closed 2 years ago

wistaria commented 6 years ago

現在、MateriApps LIVE! version 2.0 公開に向けて準備中です。今回ベースのDebianのバージョンが7 (Wheezy) から 9 (Stretch) に上がっているため、いろいろ不都合や足りないものなどがあるかもしれません。MateriApps LIVE! に含まれるアプリやツールが動作するかどうか、これまでのチュートリアル等が問題なく動くかどうかテストしてくださるベータテスタを募集します。

MateriApps LIVE! version 2.0b1

Version 2.0での主な変更点

MateriApps LIVE!を用いたチュートリアル

問題や要望については、本issueに書き込んでいただければ対応します。 よろしくお願いします。

wistaria commented 6 years ago

https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/wiki/GettingStarted#alps python tutorial2a.py が失敗する。tutorial2b.py 以降は正常に動作

wistaria commented 6 years ago

https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/wiki/GettingStarted#dsqss バイナリ(dla等)が全て/usr/binではなく、/usr/share/dsqss/binにインストールされている。フルパスを指定する必要あり -- 2018-07-28 fixed in https://github.com/cmsi/ma-dsqss/commit/1c893f09ba370a1c6f5ed55cb2d66512af56696f

wistaria commented 6 years ago

https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/wiki/GettingStarted#ermod

wistaria commented 6 years ago

https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/wiki/GettingStarted#gromacs Gromacs 2016.1 ではディレクトリ構成が大幅に変わっている模様。チュートリアルファイル見つからず

wistaria commented 6 years ago

https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/wiki/GettingStarted#hphi バージョンが上がりサンプルが変更になっている -- 2018-07-28 wiki を修正

wistaria commented 6 years ago

https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/wiki/GettingStarted#openmx openmx-example パッケージがインストールされていない -- 2017-07-29 修正済み https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/commit/7a814edf4c1a8d6d877bf2ba0ca98cf56c6d8881

wistaria commented 6 years ago

https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/wiki/GettingStarted#smash

wistaria commented 6 years ago

https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/wiki/GettingStarted#xtapp--tapioca /usr/bin/time コマンドがない。sudo apt install time する必要あり -- 2018-07-29 修正済み https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/commit/b2668469a3cafe31577267eece0c0bc9cf2c342b

k-yoshimi commented 6 years ago

DCoreで、 /usr/share/doc/dcore/doc/tutorial
/squares のサンプルを実行したところ、 dcore_pre dmft_square.ini で落ちました。

k-yoshimi commented 6 years ago

@wistaria DCoreのtestが通るか確認したいのですが、どこでmake testをすればいいでしょうか？

wistaria commented 6 years ago

＠k-yoshimi 確認ありがとうございます。 TRIQS のテストが i386 でコンパイルに失敗するので、test 全体を disable していたのですが、テストのソースを直して動くようにした triqs_1.4.2-3 を準備中です

wistaria commented 6 years ago

@k-yoshimi まず、TRIQS本体のテスト結果は以下の通りです

90% tests passed, 2 tests failed out of 21

The following tests FAILED:
      4 - pre_preset (Failed)
     17 - check_chain_alpsqmc (Failed)
k-yoshimi commented 6 years ago

@wistaria ありがとうございます.お手数おかけしますが宜しくお願いします。 DCoreのエラーを見ると、numpy関係のエラーで引っかかっているようです.

File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/pytriqs/applications/dcore/dcore_pre.py", line 462, in dcore_pre
    converter.convert_dft_input(weights_in_file=weights_in_file)
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/pytriqs/applications/dft/converters/hk_converter.py", line 175, in convert_dft_input
    [crsh['dim'] for crsh in corr_shells]), max(n_orbitals)], numpy.complex_)
TypeError: only integer scalar arrays can be converted to a scalar index

テスト結果のうち、4がおそらく上述のエラーと関係しているものと思われます. 17はalpscore/cthyb と triqs_interfaceのインストールがされていないことがエラーの原因だと思われます.

wistaria commented 6 years ago

@k-yoshimi これですね https://github.com/TRIQS/dft_tools/commit/129ae1e068c6a530607afa1b82e672fb011406dc dfttools にこのパッチをあててみます

shinaoka commented 6 years ago

@wistaria 返信が遅くなりました私のパッチはdft_tools 1.4に入っていると思っていましたが。 よろしくお願いします。

shinaoka commented 6 years ago

@wistaria 大槻さんは以下のコミット(d005756)を使っているそうです。 私はd00575632c4c0aa0fd2ca6f09cbab25f7cd275a3を手元で使っています。

https://github.com/issp-center-dev/pyDMFT/issues/49#issuecomment-398622648

本当ならDFTTools側にtriqs 1.4に対応した最新版のリリースをしてもらうと助かりますが、 お手数をおかけします。

wistaria commented 6 years ago

@k-yoshimi @shinaoka triqs と triqs-dfttools をアップデートしました。

sudo apt update
sudo apt upgrade

してください。hk_converter.py のエラーは解消すると思います

k-yoshimi commented 6 years ago

@wistaria ありがとうございます。確かに解決しました。 深夜に関わらずご対応くださりありがとうございました。

wistaria commented 6 years ago

@k-yoshimi @shinaoka DCore のテストも alpsqmc を除きpassすることを確認しました

95% tests passed, 1 tests failed out of 21
The following tests FAILED:
     17 - check_chain_alpsqmc (Failed)
k-yoshimi commented 6 years ago

@wistaria こちらでもDCoreのサンプルが無事動くことの確認がとれました。ありがとうございます。大変助かりました。 明日の講習会ですが、本修正が取り込まれた2.0b2を使用すればよろしいでしょうか？ 時間的に厳しいようでしたら、2.0b1に上記アップデートを対応させたもので十分可能かと考えております.

wistaria commented 6 years ago

@k-yoshimi 他にも少しずつ直していますので、2.0b2 を出します。

wistaria commented 6 years ago

MateriApps LIVE! 2.0b2 を作成しました https://www.dropbox.com/sh/hojzc2j3lprdexj/AAClkEfDvTUSlZDQVY52-soAa?dl=0

2.0b1からの修正点

まだ対応できていないもの

引き続き皆様からの検証結果をお待ちしています

wistaria commented 6 years ago

cmake, liblapack-dev がない -- 2018-08-21 追加 in https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/commit/a9c816b228273c228e90012b9eab865f7d98f5d5

wistaria commented 6 years ago

MateriApps LIVE! 2.0b3 を作成しました https://www.dropbox.com/sh/hojzc2j3lprdexj/AAClkEfDvTUSlZDQVY52-soAa?dl=0

2.0b2からの修正点

まだ対応できていないもの

ermod のチュートリアルへの対応は version 2.1 に回す予定です alps, hphi, mvmc のチュートリアルが一通り動くことを確認でき次第、version 2.0 正式版をリリースします

動作検証結果については引き続きお待ちしています

wistaria commented 6 years ago

ParaView で Extension GL_VERSION_1_5 could not be loaded というエラーメッセージが毎回表示される

wistaria commented 6 years ago

日本語環境がない。Version 2.1 で追加する -- 2018-08-26 https://github.com/cmsi/MateriAppsLive/issues/219

wistaria commented 6 years ago

MateriApps LIVE! 2.0を公開しました

残っている問題点については2.1で修正の予定です