Undesignated S:V1264L lineage in JN.1 (271 Samples, 18 Countries)

Earlier tracked in https://github.com/sars-cov-2-variants/lineage-proposals/issues/1401 Although not fast it is quite big and still around

Defining mutations: JN.1> C5497T > S:V1264L (G25352T) Query: C5497T ,G25352T,T3565C Samples : 248

.IDs

EPI_ISL_18593890, EPI_ISL_18599951, EPI_ISL_18602001, EPI_ISL_18619780, EPI_ISL_18663535, EPI_ISL_18668211, EPI_ISL_18692245, EPI_ISL_18696840, EPI_ISL_18697169, EPI_ISL_18707775, EPI_ISL_18708838, EPI_ISL_18722379-18722381, EPI_ISL_18724921, EPI_ISL_18728312, EPI_ISL_18728795, EPI_ISL_18729289, EPI_ISL_18732331, EPI_ISL_18754855, EPI_ISL_18756986, EPI_ISL_18757010, EPI_ISL_18757215, EPI_ISL_18757353, EPI_ISL_18757421, EPI_ISL_18757474, EPI_ISL_18768678-18768679, EPI_ISL_18769009, EPI_ISL_18775369-18775370, EPI_ISL_18775373-18775374, EPI_ISL_18779349, EPI_ISL_18779488, EPI_ISL_18779954, EPI_ISL_18780009, EPI_ISL_18784573, EPI_ISL_18789992, EPI_ISL_18794088, EPI_ISL_18794952, EPI_ISL_18798117, EPI_ISL_18802118, EPI_ISL_18803585, EPI_ISL_18804641, EPI_ISL_18804689, EPI_ISL_18808490, EPI_ISL_18808696, EPI_ISL_18808806, EPI_ISL_18817322, EPI_ISL_18817346, EPI_ISL_18821236, EPI_ISL_18826421, EPI_ISL_18826452, EPI_ISL_18826652, EPI_ISL_18826768, EPI_ISL_18827680, EPI_ISL_18827707, EPI_ISL_18827748, EPI_ISL_18827931, EPI_ISL_18828918, EPI_ISL_18829900-18829901, EPI_ISL_18829904, EPI_ISL_18830308, EPI_ISL_18832369, EPI_ISL_18834980, EPI_ISL_18835921, EPI_ISL_18836044, EPI_ISL_18836455, EPI_ISL_18836594, EPI_ISL_18836768, EPI_ISL_18839699, EPI_ISL_18841310, EPI_ISL_18847617, EPI_ISL_18847731, EPI_ISL_18847790, EPI_ISL_18849700, EPI_ISL_18852196, EPI_ISL_18852509, EPI_ISL_18854924, EPI_ISL_18856200, EPI_ISL_18859530, EPI_ISL_18859538, EPI_ISL_18859731, EPI_ISL_18861930, EPI_ISL_18863231, EPI_ISL_18863283, EPI_ISL_18863290, EPI_ISL_18863410, EPI_ISL_18863599, EPI_ISL_18863895, EPI_ISL_18871056, EPI_ISL_18871284, EPI_ISL_18871289, EPI_ISL_18877729, EPI_ISL_18877982, EPI_ISL_18880464, EPI_ISL_18880474, EPI_ISL_18880507, EPI_ISL_18880725, EPI_ISL_18881948, EPI_ISL_18882387, EPI_ISL_18882413, EPI_ISL_18882450, EPI_ISL_18882589, EPI_ISL_18882644-18882645, EPI_ISL_18882721, EPI_ISL_18882958, EPI_ISL_18882989, EPI_ISL_18883904, EPI_ISL_18886233, EPI_ISL_18887349, EPI_ISL_18887548, EPI_ISL_18888389, EPI_ISL_18892302, EPI_ISL_18892367, EPI_ISL_18893294, EPI_ISL_18895135, EPI_ISL_18895209, EPI_ISL_18896870, EPI_ISL_18905448, EPI_ISL_18908732, EPI_ISL_18914888, EPI_ISL_18917603, EPI_ISL_18919407, EPI_ISL_18919434, EPI_ISL_18920155, EPI_ISL_18920201, EPI_ISL_18920450, EPI_ISL_18920567, EPI_ISL_18920734, EPI_ISL_18920958, EPI_ISL_18921045, EPI_ISL_18921730-18921731, EPI_ISL_18921756, EPI_ISL_18922760, EPI_ISL_18927869, EPI_ISL_18928322, EPI_ISL_18933271, EPI_ISL_18935273, EPI_ISL_18936882, EPI_ISL_18936885, EPI_ISL_18937463, EPI_ISL_18939743, EPI_ISL_18939777, EPI_ISL_18940285, EPI_ISL_18942189, EPI_ISL_18942196, EPI_ISL_18942294, EPI_ISL_18942306, EPI_ISL_18942669, EPI_ISL_18948955, EPI_ISL_18948975, EPI_ISL_18948989, EPI_ISL_18953275, EPI_ISL_18954273, EPI_ISL_18955277, EPI_ISL_18956901, EPI_ISL_18958392, EPI_ISL_18958423, EPI_ISL_18959042, EPI_ISL_18961992, EPI_ISL_18962877, EPI_ISL_18964650, EPI_ISL_18965890, EPI_ISL_18969524, EPI_ISL_18971162, EPI_ISL_18971173, EPI_ISL_18971246, EPI_ISL_18972466, EPI_ISL_18972476-18972477, EPI_ISL_18972502, EPI_ISL_18973565-18973566, EPI_ISL_18974531, EPI_ISL_18974670, EPI_ISL_18978410, EPI_ISL_18978514, EPI_ISL_18979066, EPI_ISL_18979357, EPI_ISL_18980806, EPI_ISL_18981097, EPI_ISL_18981622-18981623, EPI_ISL_18989575, EPI_ISL_18992652, EPI_ISL_18998761-18998762, EPI_ISL_19002256, EPI_ISL_19002507, EPI_ISL_19002827, EPI_ISL_19012558, EPI_ISL_19012659, EPI_ISL_19012692, EPI_ISL_19012701, EPI_ISL_19012751, EPI_ISL_19014113, EPI_ISL_19014282, EPI_ISL_19015462, EPI_ISL_19019693, EPI_ISL_19021241, EPI_ISL_19022761, EPI_ISL_19023246, EPI_ISL_19023249, EPI_ISL_19023258, EPI_ISL_19023371, EPI_ISL_19024291, EPI_ISL_19024634, EPI_ISL_19025946, EPI_ISL_19027368, EPI_ISL_19027421, EPI_ISL_19027741, EPI_ISL_19030233, EPI_ISL_19035384, EPI_ISL_19037457, EPI_ISL_19037477, EPI_ISL_19037675, EPI_ISL_19037761, EPI_ISL_19038638, EPI_ISL_19038857, EPI_ISL_19040436, EPI_ISL_19040449, EPI_ISL_19040899, EPI_ISL_19043505, EPI_ISL_19044172, EPI_ISL_19044556, EPI_ISL_19049454, EPI_ISL_19057134, EPI_ISL_19060334, EPI_ISL_19060349, EPI_ISL_19064161-19064162, EPI_ISL_19065046, EPI_ISL_19065055, EPI_ISL_19066917, EPI_ISL_19068427, EPI_ISL_19069813, EPI_ISL_19073156, EPI_ISL_19073778, EPI_ISL_19074022, EPI_ISL_19076824, EPI_ISL_19077208, EPI_ISL_19077454, EPI_ISL_19079475

First collected in Germany on 2023-11-21 Countries: 18 ( main country is US ) Tree:

https://nextstrain.org/fetch/genome-test.gi.ucsc.edu/trash/ct/subtreeAuspice1_genome_test_62e2b_f6dc50.json?f_userOrOld=uploaded%20sample&label=id:node_6939566

cov-lineages / pango-designation

Undesignated S:V1264L lineage in JN.1 (271 Samples, 18 Countries) #2573