creativeishu / AIM_IBM_KGO

1 stars 0 forks source link

Chemical compounds should link to their constituent elements #9

Closed ralphk86 closed 10 years ago

ralphk86 commented 10 years ago

MIDs for all chemical elements

{u'Ru': u'/m/025scl1', u'Re': u'/m/025scmg', u'Rf': u'/m/025sd1x', u'Rg': u'/m/025tpyw', u'Ra': u'/m/025scm7', u'Rb': u'/m/025sckv', u'Rn': u'/m/025scmp', u'Rh': u'/m/025scm0', u'Be': u'/m/025sq7x', u'Ba': u'/m/025svml', u'Bh': u'/m/025s_py', u'Bi': u'/m/025svp8', u'Bk': u'/m/025svnm', u'Br': u'/m/025svll', u'H': u'/m/02h9byz', u'P': u'/m/025s7x6', u'Os': u'/m/025s6b_', u'Ge': u'/m/025rs3d', u'Gd': u'/m/025rs3m', u'Ga': u'/m/025rs35', u'Pr': u'/m/025sc08', u'Ute': u'/m/07kvy3', u'Pt': u'/m/025s7y2', u'Pu': u'/m/026mkzy', u'C': u'/m/025tfgm', u'Pb': u'/m/025r_0t', u'Pa': u'/m/025s7xw', u'Pd': u'/m/025s7xf', u'Cd': u'/m/025tksd', u'Po': u'/m/025s7y9', u'Pm': u'/m/025s7xn', u'Uut': u'/m/026bqpv', u'Uuq': u'/m/026bqm6', u'Uup': u'/m/025tzk3', u'Uus': u'/m/025tzmz', u'Uuo': u'/m/025tsrz', u'Ho': u'/m/025rtj9', u'Uue': u'/m/0hr4p', u'Hf': u'/m/025rtjj', u'Hg': u'/m/025sw5g', u'He': u'/m/025rt79', u'Md': u'/m/025s0rf', u'Mg': u'/m/025s0s0', u'K': u'/m/02kcq04', u'Mn': u'/m/025s0zp', u'O': u'/m/025s6bf', u'Mt': u'/m/025s2kx', u'S': u'/m/025sf9q', u'W': u'/m/025sk79', u'Zn': u'/m/025sqz8', u'Eu': u'/m/028bf0d', u'Es': u'/m/028bh5n', u'Er': u'/m/028bg3q', u'Ni': u'/m/025s4r7', u'No': u'/m/025s4s4', u'Na': u'/m/02kcq1_', u'Nb': u'/m/025s4rg', u'Nd': u'/m/025s4rp', u'Ne': u'/m/025s4r0', u'Np': u'/m/025s4ry', u'Fr': u'/m/025rqcb', u'Fe': u'/m/02kcv_c', u'Fm': u'/m/025rqck', u'B': u'/m/0bnv6p5', u'F': u'/m/025rqc3', u'Sr': u'/m/025sf8p', u'Uth': u'/m/07kwcp', u'Uto': u'/m/07kvrh', u'N': u'/m/025s4ld', u'Uts': u'/m/05lynv', u'Si': u'/m/025sf80', u'Sn': u'/m/025sk5n', u'Sm': u'/m/025sf93', u'V': u'/m/025sngq', u'Sc': u'/m/025sf87', u'Sb': u'/m/027s2zq', u'Sg': u'/m/025sgk0', u'Se': u'/m/025sf8g', u'Co': u'/m/025tkrf', u'Cn': u'/m/025t_2_', u'Cm': u'/m/025tkv0', u'Cl': u'/m/025tkqp', u'Ca': u'/m/025tkqy', u'Cf': u'/m/025tkv8', u'Ce': u'/m/025tktq', u'Xe': u'/m/025sqqf', u'Tm': u'/m/025sk7j', u'Cs': u'/m/025tnb6', u'Cr': u'/m/025tkr6', u'Cu': u'/m/025rsfk', u'La': u'/m/025rz_s', u'Li': u'/m/025rzqx', u'Lv': u'/m/025tsrr', u'Tl': u'/m/025skld', u'Lu': u'/m/025rz__', u'Lr': u'/m/025r_0l', u'Th': u'/m/025sk62', u'Ti': u'/m/025sk56', u'Te': u'/m/025sk5w', u'Tb': u'/m/025sk71', u'Tc': u'/m/025sk5f', u'Ta': u'/m/025sk7r', u'Ubt': u'/m/04ztzs', u'Ubu': u'/m/047n69', u'Ubp': u'/m/03hft_m', u'Ubq': u'/m/02p6l9k', u'Ubs': u'/m/03hft__', u'Yb': u'/m/025sqvg', u'Db': u'/m/0274b33', u'Zr': u'/m/025sqzx', u'Ubb': u'/m/025rsdc', u'Dy': u'/m/026rjl1', u'Ubn': u'/m/0hr49', u'Ubo': u'/m/02p6lmn', u'Ubh': u'/m/03p6rr', u'Ds': u'/m/025syct', u'I': u'/m/025rw2h', u'In': u'/m/025rw28', u'U': u'/m/025smjn', u'Y': u'/m/025sqv7', u'Ac': u'/m/027sjs4', u'Ag': u'/m/025sf8x', u'Kr': u'/m/0286yf3', u'Ir': u'/m/025rw2y', u'Am': u'/m/027sxty', u'Al': u'/m/027vj2v', u'As': u'/m/027rq1r', u'Ar': u'/m/027r9df', u'Au': u'/m/025rs2z', u'At': u'/m/027t9kn', u'Hs': u'/m/025rtwf', u'Mo': u'/m/025s0zx'}

ralphk86 commented 10 years ago

new tool compounds_to_elements.py

ralphk86 commented 10 years ago

Bug: hydrogen is not included, because it's never mentioned in the smiles.