Interaction networck: Unlabeled data points (too many overlaps)

[Henrique-reolon]

Olá @pedrostrusso ! Primeiramente gostaria de agradecer pelo desenvolvimento desta excelente ferramenta, bem como pela presteza em responder minha última solicitação. Agora estou enfrentando um novo problema com relação a rede de interação:

• Ao rodar o comando: generate_report(cem, directory="./Report"), tenho recebido a seguinte mensagem de erro: 1: ggrepel: 14 unlabeled data points (too many overlaps). Consider increasing max.overlaps. Poderia me ajudar a resolver tal questão? Desde já agradeço pela atenção!

[pedrostrusso]

Oi @Henrique-reolon, experimente rodar o seguinte comando: options(ggrepel.max.overlaps = Inf). Pelo que eu entendi o problema é que como os módulos são muito grandes, o ggrepel (o pacote que usamos pra fazer as anotações dos genes) acha que tem coisa demais pra anotar e/ou que as anotações acabam se sobrepondo. Note que com o comando que citei esse cuidado do pacote de não sobrepor as anotações pode acabar sendo sobreescrito.

[Henrique-reolon]

Obrigado @pedrostrusso, problema resolvido!