cytomine / Cytomine-core

Cytomine-Core is the main web server implementing the Cytomine API
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[CYTO-586] Extension images multi-dimensionnelles #529

Closed stevben closed 10 years ago

stevben commented 10 years ago

[reporter="rmaree", created="ven., 4 mai 2012 15:32:01 +0200"]

On supporte actuellement des images 2D. Nous avons déjà des échantillons "3D" en quelque sorte (couche de lames histologiques pour un même échantillon).
Une extension à des images multi-dimensionnelles sera sans doute nécessaire un jour...
La dimension 3 correspond à des "slices"/"stacks"
La dimension 4 au temps (vidéo)
La dimension 5 aux channels (dans le cas d'images fluorescentes par exemple).
--> Cela implique des modifications aux niveaux:

stevben commented 10 years ago

[author="rmaree", created="mar., 30 oct. 2012 02:44:43 +0100"]

Maldi: 2D + channels (un channel = 1 m/z, potentiellement milliers de channels)
Crystallization: 2D + channels (3 channels: visible, phi, sindelta)
Fluorescent images: 2D + channels (1 channel = 1 fluorescent dye)
Lung lbtd: 3D
cytology with z-stacks: attention c'est du z-stacks optique, pas vraiment la même chose que 3D