search

davidperezmartorell / forestMap

Map of forests and studies or inventories during the time
0 stars 0 forks source link

me faltan DOIS #113

Closed davidperezmartorell closed 8 months ago

davidperezmartorell commented 8 months ago

cuando voy a representar los datos, me faltan dois cuando estuve mirando de la union de varios detos de excels, pdf's, words, me salian 58 estudios, pero ahora que voy a trabajar la union de assembleages con citation para agregarles el DOI, me salen muchos vacios. Los voy a agregar en la tabla citation. son estos (agrego el código que voy usando en archivo pruebas.R

Load data

citation_data <- read.csv("inst/citation_data.csv", stringsAsFactors = FALSE, sep = ";", header = TRUE, fileEncoding = "latin1", dec = ",") assembleages <- read.csv("inst/comm_nodist_plants.csv", sep = ";", header = TRUE, fileEncoding = "latin1", dec = ",")

Assuming 'assemblages' is an sf object

assemblages_ori <- st_drop_geometry(assembleages)

Merge citation data with assemblages based on the citation column

assemblages_merged <- merge(assemblages_ori, citation_data, by = "citation", all.x = TRUE) assemblages_merged2 <- assemblages_merged %>% select (id_study,Title, DOI) %>% filter(is.na(DOI)) %>% unique()

Aqui esta el resultado. lo agrego en imagen que se ve mejor faltan

davidperezmartorell commented 8 months ago

sigo investigando...veo que si comparo "a mano" los datos de assembleages y citation, si hay un DOI para cada id_sdudy....

davidperezmartorell commented 8 months ago

vale, ya encontré el error. PArece que comparaba en assembleages el valor citation_ori y en citation_data el valor que contiene la info es citation Modifico el nombre de columna de citation_data y comparo. Me salen estos valores en el merge assemblages_merged2 %>% filter(DOI == "") %>% select(citation, DOI) %>% unique()

estos no tienen DOI. voy a buiscar que les ocurre citation DOI 1 Eilu and Obua 2005
7 Leiva 2009
13 Lopez-Jimenez 2019
20 Upadhaya et al. 2015
29 Williams 2000

davidperezmartorell commented 8 months ago

no entiendo, los datos estan en ambos lados

davidperezmartorell commented 8 months ago

todos los DOIS corregidos. Ademas que he agregado al info de todo, aparece directamente el enlace. Este issue creo que lo creé porque en algunos casos no aparecía el dato y era porque mezclaba variables citation con citation_ori

Tengo mas info en citation que la que mostramos. LA cogí por si acaso en una búisqueda manual, pero solo necsitamos el DOI. Tengo autores, año, enlaces paralelos, librerias..etc.... todo lo que teniamos en nuestras citas