dongzhang0725
commented
1 year ago 仔细检查下你的序列里面是不是有i，以及看下你序列的名字里面是不是也有不被识别的字符。
Chenxiaona @.***> 于2023年5月10日周三 17:07写道：
老师，您好。对序列进行比对时出现了以下问题，这里报错的意思时序列里面含有特殊字符吗？我检查了所有序列，里面没有特殊字符，对于这种情况，我应该如何解决这个问题？ 还有，如果没有解决以下报错问题的话，我把这些序列在其他软件(geneious)进行比对后，再到phylosuite跑树的话还会报错吗？ Gap Penalty = -1.53, +0.00, +0.00 === Alphabet 'i' is unknown. === Please check site 1 in sequence 9497. === To make an alignment that has unusual characters (U, @, #, etc), try === % mafft --anysymbol input > output Illegal character i
— Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/dongzhang0725/PhyloSuite/issues/70, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/ADZXXOKYOHSA7DMFJ3SOCPTXFNLEJANCNFSM6AAAAAAX4N2YIA . You are receiving this because you are subscribed to this thread.Message ID: @.***>
老师，您好。对序列进行比对时出现了以下问题，这里报错的意思时序列里面含有特殊字符吗？我检查了所有序列，里面没有特殊字符，对于这种情况，我应该如何解决这个问题？ 还有，如果没有解决以下报错问题的话，我把这些序列在其他软件(geneious)进行比对后，再到phylosuite跑树的话还会报错吗？ Gap Penalty = -1.53, +0.00, +0.00 === Alphabet 'i' is unknown. === Please check site 1 in sequence 9497. === To make an alignment that has unusual characters (U, @, #, etc), try === % mafft --anysymbol input > output Illegal character i