串联问题 - Githubissues

张老师好，请教一个问题。我刚使用phylosuite，不知道是否有实现，我还未找到。就是比如我有两百个样品，我打算串联三个基因片段建树。但每个基因总会有数个样品是没有的，而且我的样品里面有多个样品是同一个种。而phylosuite串联需要相同的名称，在phylosuite里我很难对一个基因的所有样品很好的编号以及改名字，而且我必须准确改好每个样品的三个基因的名字。我想请教phylosuite是否能很方便地解决这种问题。可能我放一个包含序号，物种信息（有时需要加入地点等信息）、序列号的excel表，就能给我得到一份改好名字的序列。比如得出类似：>1_M__Subspeluncae_ZXL7016_Yunnan_China

感谢！

基因缺样品是没问题的，串联的原理可以看这个protocol，要序列名字一样才能被串联在一起： https://mp.weixin.qq.com/s/my1tp_OY6iy2USPbqoJ3VQ

Indusia-sori @.***> 于2024年7月22日周一 16:43写道：

张老师好，请教一个问题。我刚使用phylosuite，不知道是否有实现，我还未找到。就是比如我有两百个样品，我打算串联三个基因片段建树。但每个基因总会有数个样品是没有的，而且我的样品里面有多个样品是同一个种。而phylosuite串联需要相同的名称，在phylosuite里我很难对一个基因的所有样品很好的编号以及改名字，而且我必须准确改好每个样品的三个基因的名字。我想请教phylosuite是否能很方便地解决这种问题。可能我放一个包含序号，物种信息（有时需要加入地点等信息）、序列号的excel表，就能给我得到一份改好名字的序列。比如得出类似：>1_M__Subspeluncae_ZXL7016_Yunnan_China

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dongzhang0725 / PhyloSuite

串联问题 #98