dreamRs / conrappli

shiny app for mapping and computing preliminary IUCN conservation status for plants
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render rmd #35

Open gdauby opened 11 months ago

gdauby commented 11 months ago

Les deux rapports du module-report.R ne s'affichent pas dans la version déployé. Dans le log je vois le message :

2023-10-04T13:00:47.298749+00:00 shinyapps[10067371]: processing file: all_tax_report.Rmd 2023-10-04T13:00:47.303773+00:00 shinyapps[10067371]: 1/1 2023-10-04T13:00:47.308528+00:00 shinyapps[10067371]: Warning in file(con, "w") : 2023-10-04T13:00:47.313306+00:00 shinyapps[10067371]: cannot open file 'all_tax_report.knit.md': Permission denied 2023-10-04T13:00:47.318307+00:00 shinyapps[10067371]: Error: cannot open the connection

Pour savoir si c'est un problème dans le code du Rmd, j'ai supprimé tout le contenu du Rmd (voir la branche test_rmd que j'ai créé), mais c'est le même problème. Donc je ne vois pas trop ou ça pourrait être.

Le Rmd que l'on télécharge dans le module 2 fonctionne sans problème, mais ce n'est pas exactement le même code qui est derrière : le rmarkdown::render est inclus dans un downloadHandler

pvictor commented 11 months ago

Oui un problème de droit en écriture sur le serveur à priori, je vais chercher une solution.

gdauby commented 11 months ago

As tu pu trouver une solution ? Sinon une alternative serait de convertir la sortir Rmd en outputs shiny (et ne garder le Rmd que pour téléchargement, comme dans le module 2). Mais c'est plus de travail.

pvictor commented 11 months ago

La génération des rapports fonctionne mais pas l'affichage pour l'instant. Oui c'est ce qui était fait au début, mais ça demande de générer les rapports en double.

pvictor commented 11 months ago

J'ai remis l'ancien système, tout devrait fonctionner correctement