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ecotaxa / ecopart

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Incohérence dans la base de données #43

Open grololo06 opened 3 years ago

grololo06 commented 3 years ago

En francais: Un projet EcoPart doit être lié à un projet EcoTaxa si au moins un de ses samples est lié à un sample EcoTaxa. En SQL: select * from part_projects pp where pp.projid is null and exists (select 1 from part_samples ps where ps.pprojid = pp.pprojid and ps.sampleid is not null); Résultat sur la prod' (anonymisé à la main):

 pprojid |                 ptitle                 |                            rawfolder                            | ownerid | projid | instrumtype |      op_name      |           op_email            |         cs_name          |       cs_email        |    do_name    |         do_email          | prj_info |  prj_acronym  |    cruise     |   ship   | default_instrumsn | default_depthoffset |  oldestsampledate   | public_partexport_deferral_month | public_visibility_deferral_month | public_zooexport_deferral_month | remote_type | remote_directory | remote_password | remote_url | remote_user | remote_vectorref | enable_descent_filter 
---------+----------------------------------------+-----------------------------------------------------------------+---------+--------+-------------+-------------------+-------------------------------+--------------------------+-----------------------+---------------+---------------------------+----------+---------------+---------------+----------+-------------------+---------------------+---------------------+----------------------------------+----------------------------------+---------------------------------+-------------+------------------+-----------------+------------+-------------+------------------+-----------------------
     284 | uvp6_sn000125hf_20201022_rade_test_cdt | local_plankton/uvp/uvp_c/uvp6_sn000125hf_20201022_rade_test_cdt |     768 |        | uvp6        | xxxxx  |                          |                       |               |                           |          | rade test cdt | rade test cdt | sagitta3 | sn000125hf        |                     | 2020-10-22 11:11:18 |                               24 |                                2 |                              36 |             |                  |                 |            |             |                  |  
      33 | uvp5_sn002zd_cascade2011               | local_plankton/uvp/uvp_b/uvp5_sn002zd_cascade2011               |      18 |        | uvp5        | xxxxx |          | cascade 2011  | cascade2011   | atalante | sn002zd           |                 1.2 | 2011-03-02 15:54:50 |                               24 |                                2 |                              36 |             |                  |                 |            |             |                  |  
     286 | uvp6_sn000125hf_20201015_rade_testctd  | local_plankton/uvp/uvp_c/uvp6_sn000125hf_20201015_rade_testctd  |     768 |        | uvp6        | xxxxx |                          |                       |               |                           |          | rade_testctd  | rade_testCTD  | sagitta3 | sn000125hf        |                     | 2020-10-15 07:47:14 |                               24 |                                2 |                              36 |             |                  |                 |            |             |                  |  
(3 lignes)

Ces 3 projets contiennent des samples liés mais ne sont pas liés eux-même.

jiho commented 3 years ago

Si je me souviens bien, j'ai aussi remarqué l'inverse: projets liés mais aucun sample lié.

jiho commented 3 years ago

Et il faudrait aussi tester le cas où des samples ecopart sont liés à plusieurs projets EcoTaxa. Normalement la règle pour les liens de projets était

EcoPart | EcoTaxa
----------------- 
1       | 1       = OK
n       | 1       = OK
1       | n       = Not OK
grololo06 commented 3 years ago

Projets EcoTaxa avec n projets EcoPart:

ecotaxa=# select prj.projid, count(pp.pprojid) as cnt from projects prj, part_projects pp where pp.projid = prj.projid group by prj.projid having count(pp.pprojid) > 1;
 projid | cnt 
--------+-----
     22 |   2
     30 |   6
     35 |   6
     41 |   3
     43 |   2
     45 |   3
     63 |   2
    149 |   2
    579 |   6
   3039 |   2
   3581 |   2
(11 lignes)

L'inverse ne me semble pas possible structurellement: un projet EcoPart a un seul champ projid donc c'est 0 ou 1.