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Infos dans export xls après DA #55

Open Yo-EDyP opened 3 months ago

Yo-EDyP commented 3 months ago

Hello,

Outre qu'il manque les "ROW data" (déjà dans ticket #23) dans l'export xls, dans l'onglet "DA", je n'ai pas les valeurs de p-value et log(FC) : image

A+, Yo

samWieczorek commented 3 months ago

Pour le moment, cette information est disponible en téléchargement au format Excel lorsque l'on valide le seuil de FDR dans l'étape 4. Un bouton intitulé "Selected final results (Excel file)" devient alors actif et permet la génération du fichier Excel contenant ls infos de logFC, p-value et si l'entité est considérée comme différentielle. Une réflexion doit être menée pour améliorer le contenu du fichier Excel général.

samWieczorek commented 3 months ago

Modification : l'export excel de chacune des étapes d'un pipeline comporte désormais 2 onglets par étapes : les données de quantification et les "metadonnées". A l'issue de l'étape d'analyse différentielle, les colonnes suivantes sont ajoutées aux métadonnées : p-value, logFC, "isDifferential". Ces colonnes correspondent à la comparaison qui vient d'être validée dans l'étape. A noter que l'ensemble des valeurs de logFC et p-value est visible dans l'onglet des métadonnées de l'étape du test d'hypothèse.

samWieczorek commented 2 months ago

Un onglet a été rajouté (au début de la liste) et qui contient l'ensemble des valeurs des paramètres pour les processus utilisés. Le format est pour le moment assez basique mais l'information est présente

samWieczorek commented 2 months ago

En lien avec le ticket #44