Nombre de cognats dans les données simulées

emmakopp1 / phylogeny_trust

This project aims to validate (or invalidate) a phylogenetic tree estimation.

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Nombre de cognats dans les données simulées #11

Closed tpellard closed 3 months ago

tpellard commented 3 months ago

L'article dit qu'on a généré des cognat dans la simulation mais ne dit pas combien. Est-ce qu'on a l'info dans un fichier quelquepart? ça permettrait aussi de calculer la borne de Δ^T pour les données simulées

emmakopp1 commented 3 months ago

Oui dans tree_sim.nex dans le fichier preprocess_simulated_data :

`#NEXUS

BEGIN DATA; DIMENSIONS NTAX=50 NCHAR=3784; FORMAT DATATYPE=BINARY GAP=- MISSING=?; MATRIX`

tpellard commented 3 months ago

Ah oui désolé, je n'avais pas cherché dans ce dossier