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emmakopp1 / phylogeny_trust

This project aims to validate (or invalidate) a phylogenetic tree estimation.
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Bug temp.R #16

Closed emmakopp1 closed 5 months ago

emmakopp1 commented 5 months ago

Je n'arrive pas à run la variable dt_real ligne 68. Voici mon erreur :

Error in map(): ℹ In index: 4. Caused by error in file(): ! invalid 'description' argument

Backtrace: ▆

  1. ├─dplyr::slice(...)
  2. ├─dplyr::group_by(...)
  3. ├─dplyr::rename(...)
  4. ├─dplyr::mutate(...)
  5. ├─dplyr::filter(...)
  6. └─purrr::map_df(...)
  7. └─purrr::map(.x, .f, ...)
  8. └─purrr:::map_("list", .x, .f, ..., .progress = .progress)
  9. ├─purrr:::with_indexed_errors(...)
    1. │ └─base::withCallingHandlers(...)
    2. ├─purrr:::call_with_cleanup(...)
    3. └─global .f(.x[[i]], ...)
    4. ├─dplyr::bind_cols(...)
    5. │ └─rlang::list2(...)
    6. └─global get_all_parameters(logfile, nexusfile, burnin = burnin)
    7. ├─dplyr::mutate(...)
    8. ├─dplyr::mutate(...)
    9. ├─dplyr::mutate(...)
    10. ├─dplyr::mutate(...)
    11. ├─dplyr::relocate(...)
    12. ├─dplyr::bind_cols(get_nexus_parameters(nexusfile), get_tracerlog_parameters(logfile))
    13. │ └─rlang::list2(...)
    14. └─global get_nexus_parameters(nexusfile)
    15. └─TreeTools::ReadAsPhyDat(file)
    16. ├─TreeTools::MatrixToPhyDat(ReadCharacters(...))
    17. └─TreeTools::ReadCharacters(...)
    18. └─TreeTools:::.UTFLines(filepath, encoding)
    19. └─base::file(filepath, encoding = encoding)

As-tu une idée du problème ?